156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3031 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  100 
 
 
197 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  37.17 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  35.53 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  37.95 
 
 
207 aa  128  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  37.37 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  32.29 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  32.81 
 
 
197 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  31.34 
 
 
198 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  29.08 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  32.35 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  32.18 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  30.69 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  34.03 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  29.5 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  30.2 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  35 
 
 
198 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  28.8 
 
 
210 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  29.35 
 
 
230 aa  85.9  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  30.41 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  30.41 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  29.9 
 
 
229 aa  81.3  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  31.12 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  29.29 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  27.37 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  29.9 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  29.35 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  29.08 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  32.29 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  28.28 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  28.28 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  27.18 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  27.92 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  28.43 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  26 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  27.5 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  27.5 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  27.98 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  27.6 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  28.86 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  27.51 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  29.84 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  27.64 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  30.5 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  26.83 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  27.86 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  27.84 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  27.86 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  27.89 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  28.35 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  29.1 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  24.49 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  29.74 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  26.67 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  29.21 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  28.93 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  28.85 
 
 
258 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  28.85 
 
 
258 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  28.71 
 
 
250 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  26.5 
 
 
261 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  26.87 
 
 
235 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  26.34 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  62  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  25.89 
 
 
217 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  29.33 
 
 
236 aa  61.6  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  29.84 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  28.35 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  29.65 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  29.27 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  26.53 
 
 
261 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  25.52 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  23.15 
 
 
270 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  28.14 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  29.74 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  25.24 
 
 
267 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  25.26 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  28.06 
 
 
219 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  26.04 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  27.78 
 
 
252 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  26.04 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  28.78 
 
 
244 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  26.04 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  26.04 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  26.09 
 
 
212 aa  58.2  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  26.94 
 
 
201 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  26.94 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  26.94 
 
 
201 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  27.23 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  25.74 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  28.78 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  29.23 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  26 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  27.78 
 
 
253 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  23.59 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  28.72 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  24.37 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  23.83 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  26.77 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  26.84 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>