164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2258 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  76.65 
 
 		 201 aa  301  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  60.51 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  48.48 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  41.62 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  40.1 
 
 		 219 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  40.5 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  37.56 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  37.11 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  35.03 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  35.03 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  34.2 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  26.9 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  33.16 
 
 		 186 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  35.38 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  31.34 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  30.85 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  32.67 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  32.99 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  31.79 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  31.79 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  31.79 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  32.82 
 
 		 208 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  30.26 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  30.77 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  31.47 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  31.79 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  32.29 
 
 		 245 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  31.79 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  27.86 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  31.79 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  32.29 
 
 		 245 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  29.74 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  32.11 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  32.11 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  32.11 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  32.11 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  32.11 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  32.12 
 
 		 243 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  31.28 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  32.65 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  30.41 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  30.3 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  31.44 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  31.07 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  30.33 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  30.77 
 
 		 237 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  24.74 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  32.11 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  31.09 
 
 		 235 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  29.9 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  27.78 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  27.78 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  29.74 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  31.94 
 
 		 231 aa  85.5  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  31.94 
 
 		 231 aa  85.5  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  27.23 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  30.26 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  29.95 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  29.74 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  28.12 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  31.77 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  28.5 
 
 		 216 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  28.5 
 
 		 216 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  28.12 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  28.12 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  28.12 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  28.12 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  28.12 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  28.12 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  28.65 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  27.64 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  30.21 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  30.21 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  28.12 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  27.98 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  26.42 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  31.18 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  28.35 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  26.9 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  28.21 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  31.12 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  29.19 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  29 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_861  hypothetical protein  28.12 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0205305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  26.56 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  31.41 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  25.49 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  24.12 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  25.73 
 
 		 270 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  25.13 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  24.37 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  23.88 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  29.21 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0702  hypothetical protein  24.5 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.368955  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  28.02 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  24.74 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01799  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  25.37 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>