145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5011 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  100 
 
 
207 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  44.55 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  39.89 
 
 
186 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  37.95 
 
 
197 aa  138  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  34.39 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  32.47 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  35.78 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  32.49 
 
 
197 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  31.05 
 
 
198 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  32.52 
 
 
198 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  28.43 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  32.5 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  28.64 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  29.84 
 
 
229 aa  88.6  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  28 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  28.87 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  29.17 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  29.05 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  29.95 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  27.4 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  24.62 
 
 
258 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  28.21 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  28.5 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  24.02 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  29.15 
 
 
235 aa  74.7  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  23.04 
 
 
257 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  29.9 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  24.38 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  25.93 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  26.04 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  30.61 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  28.7 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  25.24 
 
 
235 aa  72  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  26.26 
 
 
267 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  25.87 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  25.25 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  24.39 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  28.72 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  26.9 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  24.24 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  25.26 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  27.64 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  27.64 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  30 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  25.87 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  23.04 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  27.64 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  28.36 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  25.13 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  24.87 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  24.64 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  25.13 
 
 
253 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  24.07 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  23.08 
 
 
281 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  30.41 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  23.08 
 
 
281 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  29.49 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  26.29 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  25.62 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01799  hypothetical protein  28.33 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  23.08 
 
 
268 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2920  protein of unknown function DUF502  29.63 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  30.24 
 
 
237 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  24.34 
 
 
225 aa  61.6  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  29.76 
 
 
217 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  25.62 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  25.63 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  30.65 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  27.27 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  30.65 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  24.15 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  27.08 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  23.81 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  28.14 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  27.18 
 
 
255 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  28.22 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  28.22 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  28.22 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  26 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  27.04 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  28.22 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  28.71 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  25.98 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  27.86 
 
 
255 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  23.81 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  29.08 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  30.41 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  25.25 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  26.96 
 
 
243 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  26 
 
 
216 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  26.18 
 
 
223 aa  55.1  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  27.66 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1497  hypothetical protein  27.27 
 
 
238 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000491692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0736  hypothetical protein  25.83 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  25.83 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  25.16 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>