151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1357 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  59.38 
 
 
220 aa  251  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  36.59 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  35.27 
 
 
205 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  37.61 
 
 
219 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  34.58 
 
 
213 aa  121  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  37.57 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  34.2 
 
 
198 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  32.09 
 
 
200 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  30.2 
 
 
198 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  34.87 
 
 
193 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  34.07 
 
 
186 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  28.8 
 
 
219 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  29.22 
 
 
230 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  28.8 
 
 
197 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  29.74 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  30.81 
 
 
212 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  29.63 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  29.63 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  30.19 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  28.7 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  29.61 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  27.36 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  28.7 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  26.64 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  28.27 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  29.47 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  26.01 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  27.18 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  27.93 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  32.11 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  23.92 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  25.94 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  25.84 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  26.57 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  27.32 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  29.41 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  25.26 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  28.22 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  25.13 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  28.04 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  25.93 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  27.81 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  26.18 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  27.72 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  25.71 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  27.1 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  29.1 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  25.12 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  26.6 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  25.48 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  24.76 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  25.26 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  25.26 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  25.44 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  24.21 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  25.6 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  25.6 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  25 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  25.45 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  25.36 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  25.34 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  26.24 
 
 
218 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  26.6 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  25.12 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  27.98 
 
 
190 aa  62.4  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  25.98 
 
 
217 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  24.35 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  26.09 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  28.06 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  28.06 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  23.71 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  25.14 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  29.25 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  28.38 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  23.78 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  23.78 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  23.78 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  23.78 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  26.23 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  25.93 
 
 
207 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  25.79 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  25.13 
 
 
216 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  25.13 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  25.13 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  25.13 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  25.13 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  25.13 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  25.13 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  23.2 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  24.88 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  26.44 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  24.24 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  28.12 
 
 
193 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  24.06 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>