153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1402 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  66.51 
 
 		 235 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  65.58 
 
 		 235 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  64.65 
 
 		 235 aa  301  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  58.05 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  49.02 
 
 		 261 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  49.03 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  50.25 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  49.51 
 
 		 261 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  48.15 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  46.6 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  46.77 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  51.46 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  48.13 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  48.13 
 
 		 281 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  48.13 
 
 		 281 aa  214  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  48.04 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  47.78 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  47.29 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  46.49 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  48.8 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  45.27 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  43.93 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  45.1 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  41.35 
 
 		 245 aa  175  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  40.62 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  39.35 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  40.7 
 
 		 209 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  40.7 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  37.86 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  37.37 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  37.13 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  38.83 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  39.11 
 
 		 209 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  39.11 
 
 		 209 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  38.38 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  33.78 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  38.61 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  36.36 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  36.36 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  39.35 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  36.87 
 
 		 206 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  35.24 
 
 		 236 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1497  hypothetical protein  36.75 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000491692  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  37.73 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  35.81 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  35.86 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  35.5 
 
 		 212 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  34.88 
 
 		 245 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  35.15 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  35.64 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  35.35 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  34.88 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  36.76 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  36.76 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  37.2 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  36.14 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  34.78 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  34.98 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  35.64 
 
 		 217 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  36.76 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  33.66 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  33.66 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  33.5 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  37.69 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  37.19 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  35.98 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  34.72 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  34.88 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  31.07 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  34.58 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  32.31 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  32.04 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  34.18 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  34.18 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  34.18 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  34.58 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  36.54 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  33.82 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  32.69 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  34.11 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  34.02 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  33.51 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  34.02 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  34.02 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  33.51 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  33.51 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  33.51 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  33.51 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  34.3 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  33.51 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  33.51 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  35.86 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  33.51 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00081  hypothetical protein  35.19 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0736  hypothetical protein  35.27 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  34.3 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1335  hypothetical protein  34.86 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00071  hypothetical protein  35.75 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  35.18 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>