154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1039 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  43.92 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  39.89 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  41.3 
 
 		 212 aa  142  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  37.84 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  39.27 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  35.53 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  38.86 
 
 		 219 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  33.16 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  37.04 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  34.81 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  32.63 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  31.38 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  33.88 
 
 		 220 aa  107  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  32.99 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  33.16 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  32.81 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  31.77 
 
 		 213 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  33.68 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  34.07 
 
 		 243 aa  97.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  31.02 
 
 		 210 aa  97.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  33.85 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  94.4  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  31.35 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  32.31 
 
 		 196 aa  91.3  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  33.16 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  33.16 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  31.41 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  31.25 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  28.93 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  27.55 
 
 		 230 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  28.8 
 
 		 210 aa  85.1  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  29.74 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  31.64 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  26.77 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  28.06 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  30.26 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  31.96 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  29.59 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  28.27 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  29.9 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  30.61 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  30.61 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  27.6 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  25.38 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  29.74 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  28.35 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  30.46 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  25.13 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  27.18 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  28.8 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  26.67 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  28.14 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  26 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  31.63 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  25.87 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  29.5 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  24.63 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  27.18 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  28.5 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  25.26 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  28.5 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  28.5 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  28.64 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  24.51 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  28.5 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  25.53 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  32.98 
 
 		 231 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  32.98 
 
 		 231 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  28.64 
 
 		 235 aa  72  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  25.26 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  25.24 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  28.12 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  26 
 
 		 261 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  26 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  27.08 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  25.5 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  26.94 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  26.56 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  26.56 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  26.18 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  26.18 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  26.94 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  29.47 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  29.56 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  30.41 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  25.65 
 
 		 216 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  26.18 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  26.04 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  27.41 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  26.04 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  26.04 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  26.04 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  26.04 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  26.04 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  26.04 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  30.61 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717377 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>