161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0143 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  76.65 
 
 		 198 aa  314  6e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  58.97 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  48.22 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  43.22 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  41.21 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  40.96 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  38.58 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  37.56 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  35.53 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  37.57 
 
 		 243 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  30.3 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  33.66 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  33.16 
 
 		 186 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  34.01 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  35 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  35 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  34.5 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  30.2 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  30.77 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  29 
 
 		 190 aa  94.4  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  29.53 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  32.49 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  32.16 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  33.5 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  33.16 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  33.16 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  33.16 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  33.16 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  33.16 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  33.16 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  32.63 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  29.74 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  28.64 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  32.31 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  32.49 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  31.12 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  32.99 
 
 		 231 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  32.99 
 
 		 231 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  31.19 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  30.73 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  33.5 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  31.31 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  27.86 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  31.31 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  29.65 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  30.73 
 
 		 245 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  30.73 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  34.92 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  30.93 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  30.27 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  30.27 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  25.77 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  31.09 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  28.43 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  31.09 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  25.63 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  29.69 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  31.58 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  27.84 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  25.59 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  29.17 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  29.17 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  29.32 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  28.8 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  29.15 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  28.8 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  29.53 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  28.8 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  28.8 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  28.8 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  28.8 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  30.21 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  26 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  27.6 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  28.8 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  28.14 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  27.69 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  29.32 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  29.32 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  27.6 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  28.27 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_861  hypothetical protein  27.81 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0205305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  30.05 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  26.8 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  27.08 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  30.53 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  31.12 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  28.28 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  29.61 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  29.61 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  25.81 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  27.8 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  30.57 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  27.44 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  29.13 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  26.6 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>