65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1361 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  80 
 
 		 193 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  80 
 
 		 193 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  80 
 
 		 193 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  80 
 
 		 193 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  78.24 
 
 		 201 aa  317  6e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  78.24 
 
 		 201 aa  317  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  78.24 
 
 		 201 aa  316  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  77.72 
 
 		 200 aa  314  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  80.95 
 
 		 203 aa  313  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  77.89 
 
 		 194 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  74.74 
 
 		 190 aa  275  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  53.65 
 
 		 194 aa  223  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  31.44 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  31.61 
 
 		 213 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  30.41 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  30.65 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  27.13 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  32.43 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  29.1 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  29.32 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  27.66 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  27.32 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  26.15 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  30.41 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  26.98 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  27.64 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  28.65 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  24.87 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  30.3 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  30.3 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  28.12 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  22.75 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  24.74 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  25.39 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  25.64 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  24.38 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  22.46 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  28.5 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  20.71 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  24.73 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  26.09 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  23.59 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  19.17 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  25.12 
 
 		 270 aa  45.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  23.91 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  24.17 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00071  hypothetical protein  25.23 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1335  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1878  protein of unknown function DUF502  24.59 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  24.08 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  25.6 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  25.89 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  24.1 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  25.36 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  23.76 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  22.05 
 
 		 209 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  22.01 
 
 		 250 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  23.59 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  23.58 
 
 		 254 aa  41.2  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  23.76 
 
 		 258 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  23.76 
 
 		 258 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1260  protein of unknown function DUF502  25.22 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.633328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>