117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0976 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  100 
 
 
206 aa  410  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  34.33 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  36.36 
 
 
214 aa  117  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  37.43 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  34.81 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  31.53 
 
 
207 aa  101  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  29.79 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  33.85 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  28.35 
 
 
198 aa  88.2  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  30.22 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  27.49 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  27.13 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  27.92 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  26.54 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  26.63 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  26.83 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  27.64 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  29 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  26.14 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  26.34 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  25.23 
 
 
256 aa  62  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  29.47 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  26.29 
 
 
198 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  24.75 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  25.12 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  25.12 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  23.79 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  24.77 
 
 
261 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  24.26 
 
 
267 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  25.38 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  23.9 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  25.87 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  25.38 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  23.83 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  24.47 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  22.68 
 
 
235 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  23.96 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  24.52 
 
 
225 aa  55.1  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  26.34 
 
 
243 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  26.8 
 
 
193 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  24.34 
 
 
258 aa  54.7  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  27.13 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  27.13 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  27.27 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  27.13 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  27.27 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  20.93 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  25.64 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  25.53 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  21.82 
 
 
270 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  22.27 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  25.96 
 
 
240 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  25.25 
 
 
201 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  27.78 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  25.25 
 
 
201 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  25.12 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  27.08 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  22.58 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  22.97 
 
 
255 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  25.7 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  26.83 
 
 
236 aa  48.5  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  28.5 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  25.79 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  24.02 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  22.33 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  22.33 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  27.37 
 
 
249 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  27.54 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  26.19 
 
 
245 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  23.33 
 
 
232 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  24.5 
 
 
229 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  22.33 
 
 
244 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  21.86 
 
 
234 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0736  hypothetical protein  30.61 
 
 
235 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  29.8 
 
 
207 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  29.8 
 
 
207 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  23.9 
 
 
250 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1497  hypothetical protein  26.36 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000491692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1290  protein of unknown function DUF502  21.2 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  21.76 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  26.46 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  26.24 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1878  protein of unknown function DUF502  22.64 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  26.24 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  27.23 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  24.27 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  28.5 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  26.46 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3889  protein of unknown function DUF502  22.27 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  29.95 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  22.66 
 
 
281 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  26.51 
 
 
217 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  22.66 
 
 
281 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  24.4 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  21.25 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  25.82 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  26.63 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  25.62 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  24.06 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>