164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1880 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  100 
 
 
198 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  69.04 
 
 
197 aa  299  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  39.27 
 
 
186 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  37.02 
 
 
230 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  35.05 
 
 
235 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  34.98 
 
 
235 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  30.3 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  26.9 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  34.39 
 
 
219 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  32.5 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  34.9 
 
 
196 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  28.87 
 
 
213 aa  107  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  31.44 
 
 
190 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  30.05 
 
 
219 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  31.38 
 
 
205 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  29.26 
 
 
210 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  34.38 
 
 
196 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  29.23 
 
 
193 aa  104  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  29.59 
 
 
229 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  31.07 
 
 
214 aa  102  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  33.7 
 
 
212 aa  102  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  33.5 
 
 
232 aa  101  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  30.85 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  30.2 
 
 
243 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  28.87 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  29.57 
 
 
202 aa  97.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  29.08 
 
 
235 aa  97.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  31.82 
 
 
261 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  32.32 
 
 
261 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  28.5 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  30.77 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  31.05 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  30.93 
 
 
267 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  26.96 
 
 
219 aa  94.7  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  30.2 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  30.85 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  29.5 
 
 
225 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  30.43 
 
 
258 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  30.81 
 
 
256 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  28.5 
 
 
230 aa  91.3  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  29.21 
 
 
265 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  30.5 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  30.5 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  28.87 
 
 
265 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  37.4 
 
 
214 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  29.33 
 
 
257 aa  89  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  35 
 
 
197 aa  89  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  28.21 
 
 
209 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  28.5 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  28.64 
 
 
234 aa  87.8  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  29.5 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  29.26 
 
 
231 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  29.26 
 
 
231 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  27.41 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  28.28 
 
 
235 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  28.88 
 
 
206 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  27.64 
 
 
270 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  28.85 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  26.13 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  27.78 
 
 
217 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  29.61 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  25.64 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  27.18 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  27.75 
 
 
235 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  28.79 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  28.79 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  26.32 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  27.78 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  28.21 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  28.72 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  28.72 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  28.72 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  28.72 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  28.72 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  28.72 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0702  hypothetical protein  29.5 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.368955  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  28.21 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  27.32 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  28.72 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  26.26 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  27.46 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  27.46 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  28.04 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  28 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  27.51 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  27.51 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  25.12 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  27.13 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  27.66 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  31.22 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  27.13 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  27.13 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  30.16 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  30.48 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  26.56 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  25.64 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_861  hypothetical protein  30.69 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0205305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>