162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0377 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  82.04 
 
 		 245 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  87.44 
 
 		 243 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  85.99 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  80.89 
 
 		 245 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  78.64 
 
 		 237 aa  327  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  78.16 
 
 		 217 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  76.73 
 
 		 218 aa  314  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  75.51 
 
 		 216 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  75.51 
 
 		 216 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  75.26 
 
 		 216 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  75.26 
 
 		 215 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  75.26 
 
 		 215 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  75.26 
 
 		 216 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  75.26 
 
 		 215 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  75.26 
 
 		 216 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  74.49 
 
 		 216 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  75.77 
 
 		 216 aa  307  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  75.77 
 
 		 216 aa  307  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  74.74 
 
 		 216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  75.26 
 
 		 216 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  74.23 
 
 		 216 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  70.92 
 
 		 200 aa  297  9e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  70.41 
 
 		 222 aa  284  8e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  69.35 
 
 		 209 aa  281  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  63.13 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  63.13 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  62.81 
 
 		 206 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  61 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  64.14 
 
 		 212 aa  255  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  62.89 
 
 		 208 aa  254  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  62.12 
 
 		 208 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  62.31 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  60.41 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  57.92 
 
 		 216 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  50.51 
 
 		 209 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  47.14 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  45.27 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  47.71 
 
 		 232 aa  204  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  50.51 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  56.7 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  54.68 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4012  hypothetical protein  53.96 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000640772 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  41.63 
 
 		 209 aa  185  7e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  41.63 
 
 		 209 aa  185  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  47.21 
 
 		 229 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  47.03 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  42.65 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  43.22 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1893  hypothetical protein  46.08 
 
 		 217 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0372929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  40.72 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  39.2 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  39.2 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  39.9 
 
 		 240 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  40.82 
 
 		 203 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  39.2 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  38.12 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  38.42 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  36.23 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  36.23 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  34.76 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  34.82 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  35.71 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  39.7 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  35.96 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  36.41 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  37.98 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  38.1 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1497  hypothetical protein  40.93 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000491692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  38.24 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  38.16 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  33.78 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  37.75 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  35.51 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  37.75 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  35.51 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  37.25 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  37.06 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  35.86 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  33.17 
 
 		 219 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  38 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  40.2 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  35.68 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  34.02 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  34.93 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  36.14 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  32.42 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  34.31 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0736  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  38.92 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  33.82 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  37.67 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  34.65 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  35.5 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  35.68 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  32.66 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  36.06 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  38.5 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  37.88 
 
 		 196 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>