93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1622 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  54.12 
 
 
193 aa  228  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  54.12 
 
 
193 aa  228  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  54.12 
 
 
193 aa  228  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  55.03 
 
 
193 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  55.03 
 
 
201 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  55.03 
 
 
201 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  55.03 
 
 
201 aa  226  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  55.03 
 
 
194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  53.97 
 
 
200 aa  224  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  51.32 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  53.65 
 
 
193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  51.31 
 
 
190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  28.57 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  29 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  37.19 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  27.78 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  30.46 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  30.85 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  26.49 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  26.7 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  30.89 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  29.21 
 
 
219 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  24.48 
 
 
210 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  28.65 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  24.35 
 
 
229 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  30.6 
 
 
231 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  30.6 
 
 
231 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  26.67 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  27.92 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  28.72 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  24.74 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  25.25 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  25.25 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  24.19 
 
 
243 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  24.74 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  23.26 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  25.79 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  21.65 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  25.26 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  24.62 
 
 
229 aa  51.6  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  21.65 
 
 
235 aa  51.6  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  25.65 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  23.12 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  21.84 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  21.29 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  24.27 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  23.65 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  25.74 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  25.89 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  23.08 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  23.08 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  21.57 
 
 
270 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  23.19 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_002620  TC0702  hypothetical protein  21.23 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.368955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  23.19 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  23.44 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  21.36 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  22.17 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  24.76 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  23.19 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  21.74 
 
 
235 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  22.28 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  23.19 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  23.44 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  22.28 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  23.19 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  22.28 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  23.19 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  22.28 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  23.19 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  27.23 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  25.73 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  18.52 
 
 
219 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  20.49 
 
 
209 aa  45.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  24.32 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  24.74 
 
 
245 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  23.47 
 
 
210 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  24.74 
 
 
245 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  23.15 
 
 
217 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  22.54 
 
 
255 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  23.94 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  22.44 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  23.94 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  21.78 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  24.74 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  22.73 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  23.36 
 
 
207 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  24.14 
 
 
254 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  21 
 
 
222 aa  41.6  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00071  hypothetical protein  27.97 
 
 
240 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1335  hypothetical protein  27.97 
 
 
240 aa  41.2  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>