91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1541 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  98.96 
 
 
193 aa  383  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  98.96 
 
 
193 aa  383  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  98.96 
 
 
193 aa  383  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  93.75 
 
 
201 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  93.75 
 
 
201 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  93.72 
 
 
201 aa  367  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  93.23 
 
 
200 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  91.15 
 
 
194 aa  357  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  74.87 
 
 
203 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  80 
 
 
193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  77.37 
 
 
190 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  55.03 
 
 
194 aa  228  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  32.11 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  30.69 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  33.33 
 
 
230 aa  85.1  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  28.34 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  33.16 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  28.42 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  30.16 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  27.96 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  27.55 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  27.72 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  29.03 
 
 
205 aa  61.6  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  25.52 
 
 
186 aa  61.6  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  23.78 
 
 
243 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  24.62 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  26.04 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  25.82 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  30.77 
 
 
231 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  30.77 
 
 
231 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  23.59 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  26.29 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  26.6 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  22.58 
 
 
219 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  26.53 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  24.12 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  27.13 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  20.21 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  23.38 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  25.25 
 
 
270 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  21.72 
 
 
235 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  23.81 
 
 
206 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  24.62 
 
 
190 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  23.74 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  23.5 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  24.5 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  24.5 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  24.46 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  24.62 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  22.22 
 
 
229 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  22.28 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  23 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  23 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  23.62 
 
 
216 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  23.59 
 
 
219 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  25.24 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  23.12 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  30.89 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  23.4 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  22.86 
 
 
240 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  24.48 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  24 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  24.48 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1878  protein of unknown function DUF502  25.34 
 
 
234 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  27.86 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  22.28 
 
 
237 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  21.76 
 
 
217 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1335  hypothetical protein  27.54 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  23.59 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00071  hypothetical protein  27.54 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  21.83 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1893  hypothetical protein  23.38 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0372929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  22.8 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  21.83 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  21.21 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  21.21 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  21.21 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  22.28 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  21.21 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  23.59 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  21.21 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  21.21 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  22.89 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  21.21 
 
 
216 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  21.93 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  22.04 
 
 
245 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  22.04 
 
 
245 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0702  hypothetical protein  22.33 
 
 
215 aa  41.2  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.368955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>