164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4123 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  73.74 
 
 
206 aa  279  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  71.64 
 
 
207 aa  278  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  71.64 
 
 
207 aa  278  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  69.7 
 
 
210 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  73.23 
 
 
207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  72.14 
 
 
212 aa  264  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  67.66 
 
 
208 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  62.24 
 
 
245 aa  237  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  62.24 
 
 
245 aa  237  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  61.73 
 
 
243 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  60.41 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  58.02 
 
 
245 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  56.22 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  53.27 
 
 
200 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  55.5 
 
 
237 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  58.25 
 
 
216 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  58.25 
 
 
216 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  57.73 
 
 
216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  55.38 
 
 
208 aa  215  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  57.81 
 
 
216 aa  214  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  57.81 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  54.63 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  56.77 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  56.77 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  56.77 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  56.77 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  56.77 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  56.77 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  54.87 
 
 
209 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  57.81 
 
 
216 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  57.81 
 
 
216 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  55.73 
 
 
216 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  55.38 
 
 
222 aa  206  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  48.98 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  55.17 
 
 
216 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  48.47 
 
 
209 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  51.16 
 
 
226 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4012  hypothetical protein  49.04 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000640772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  43.22 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  41.03 
 
 
209 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  41.03 
 
 
209 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  40.51 
 
 
225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  43.06 
 
 
217 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  40.4 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  46.67 
 
 
211 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  41.84 
 
 
232 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  40.69 
 
 
253 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  39.9 
 
 
216 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  40.7 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  38.69 
 
 
235 aa  151  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1893  hypothetical protein  44.02 
 
 
217 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0372929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  36.36 
 
 
281 aa  141  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  36.36 
 
 
281 aa  141  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  35.41 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  37.11 
 
 
204 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  35.18 
 
 
249 aa  137  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  37.44 
 
 
258 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  37.13 
 
 
229 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  34.6 
 
 
265 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  34.91 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  37.02 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  36.45 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  36.45 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  39.2 
 
 
219 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  36.68 
 
 
245 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1497  hypothetical protein  39.5 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000491692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  35.35 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0736  hypothetical protein  36.84 
 
 
235 aa  127  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  34.6 
 
 
265 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  34.3 
 
 
255 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  31.53 
 
 
234 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  37.95 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  32.69 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  36.92 
 
 
196 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  36.08 
 
 
203 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  39.47 
 
 
196 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  35.1 
 
 
250 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  35.82 
 
 
265 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  33.67 
 
 
219 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  34.83 
 
 
267 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  33.99 
 
 
261 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  33.01 
 
 
236 aa  122  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  34.01 
 
 
256 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  33.51 
 
 
210 aa  121  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  31.31 
 
 
219 aa  121  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  37.93 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  32.67 
 
 
257 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  33.49 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  33.83 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  33 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  33.65 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  35.51 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  30.5 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  35.51 
 
 
244 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  30.5 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  35.05 
 
 
244 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  35.9 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  33.01 
 
 
254 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>