61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2580 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  74.87 
 
 		 193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  76.19 
 
 		 193 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  76.19 
 
 		 193 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  76.19 
 
 		 193 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  73.5 
 
 		 201 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  75.66 
 
 		 201 aa  300  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  75.66 
 
 		 201 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  75.66 
 
 		 200 aa  299  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  75.13 
 
 		 194 aa  295  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  80.95 
 
 		 193 aa  294  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  71.81 
 
 		 190 aa  264  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  51.32 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  29.95 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  29.17 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  31.47 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  28.26 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  30.16 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  33.33 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  28.92 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  30.14 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  29.84 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  28.29 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  30.27 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  26.77 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  29.73 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  30.47 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  25.97 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  30.47 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  24.24 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  23.91 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  28.26 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  26.9 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  23.9 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  24.24 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  23.74 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  23.81 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  21.95 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  21.95 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  22.58 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  23.2 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  22.05 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  22.22 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  22.93 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  26.53 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  23.32 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  23.36 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  22.97 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  22.8 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  23.36 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  21.15 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  25.25 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  23.44 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  22.83 
 
 		 208 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  19.6 
 
 		 206 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  19.7 
 
 		 218 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  25.46 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  18.81 
 
 		 235 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  24.6 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  25 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>