78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1412 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  78.42 
 
 		 201 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  78.42 
 
 		 201 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  78.42 
 
 		 201 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  78.42 
 
 		 200 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  77.37 
 
 		 193 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  77.37 
 
 		 193 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  77.37 
 
 		 193 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  77.37 
 
 		 193 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  78.42 
 
 		 194 aa  300  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  71.43 
 
 		 203 aa  279  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  74.74 
 
 		 193 aa  277  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  51.31 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  32.63 
 
 		 198 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  31.55 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  32.07 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  32.98 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  35.26 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  31.89 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  31.89 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  28.04 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  29.1 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  28.12 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  30 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  27.42 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  30.05 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  25.82 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  27.81 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  27.47 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  26.23 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  26.46 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  23.12 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  22.73 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  24 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  31.01 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  31.01 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  27.08 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  24.87 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  22.7 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  24.47 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  23.08 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  23.62 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  25.13 
 
 		 235 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  23.27 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  25.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  23.53 
 
 		 240 aa  47.8  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  22.05 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  22.54 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  27.68 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  25.51 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  24.59 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_002620  TC0702  hypothetical protein  23.89 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.368955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  23.91 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  23.53 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  23.08 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  26 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  21.39 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  24.47 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  21.39 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2193  protein of unknown function DUF502  26.21 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1244  protein of unknown function DUF502  30.89 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  20.2 
 
 		 217 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0315  protein of unknown function DUF502  24.24 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3561  protein of unknown function DUF502  24.12 
 
 		 210 aa  42  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.687423  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  21.5 
 
 		 216 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1878  protein of unknown function DUF502  25.35 
 
 		 234 aa  42  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  24.21 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  24.21 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  21.5 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  20.81 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2755  protein of unknown function DUF502  25.4 
 
 		 269 aa  41.2  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  20.3 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  20.3 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  20.3 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  20.3 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  20.3 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  20.3 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>