78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2720 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  99.5 
 
 
201 aa  400  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  99 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  95.5 
 
 
200 aa  387  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  94.82 
 
 
194 aa  370  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  93.72 
 
 
193 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  93.72 
 
 
193 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  93.72 
 
 
193 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  93.72 
 
 
193 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  75.66 
 
 
203 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  78.24 
 
 
193 aa  300  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  78.42 
 
 
190 aa  286  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  55.03 
 
 
194 aa  226  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  32.11 
 
 
198 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  32.64 
 
 
230 aa  85.1  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  32.45 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  32.16 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  27.32 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  29.63 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  31.38 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  29.08 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  27.98 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  25.12 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  27.19 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  27.05 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  26.7 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  27.98 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  25.13 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  28.14 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  29.93 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  29.93 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  23.94 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  26.94 
 
 
197 aa  58.2  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  24.21 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  25.27 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  23.53 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  25.76 
 
 
270 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  25.13 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  26.23 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  24.27 
 
 
206 aa  52  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  24.35 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  25.5 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  21.43 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  25.5 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  23.5 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  22.75 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  25.53 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  26.23 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  23 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  23.2 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  23.41 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  23 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  24.1 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  24.48 
 
 
209 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  24.48 
 
 
209 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1878  protein of unknown function DUF502  26.76 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  22.5 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  22.5 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  22.28 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  23.12 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  22.49 
 
 
237 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  26.44 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  23.44 
 
 
222 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  23.32 
 
 
196 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  22.61 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  22.01 
 
 
217 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1260  protein of unknown function DUF502  21.57 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.633328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  22.8 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  22.87 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  30.95 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  25.51 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00071  hypothetical protein  27.54 
 
 
240 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  24.1 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1335  hypothetical protein  27.54 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  42  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  21.32 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>