167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0865 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  86.6 
 
 
210 aa  355  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  70.05 
 
 
207 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  74.13 
 
 
212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  70.05 
 
 
207 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  72.59 
 
 
206 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  74.11 
 
 
207 aa  298  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  67.66 
 
 
206 aa  270  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  65.82 
 
 
243 aa  269  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  64.8 
 
 
245 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  64.8 
 
 
245 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  62.76 
 
 
200 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  62.44 
 
 
235 aa  261  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  62.37 
 
 
216 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  62.37 
 
 
216 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  59.81 
 
 
218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  61.86 
 
 
216 aa  257  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  59.9 
 
 
217 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  62.5 
 
 
216 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  61.98 
 
 
216 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  59.41 
 
 
237 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  61.46 
 
 
216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  59.51 
 
 
208 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  61.46 
 
 
216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  59.9 
 
 
216 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  59.9 
 
 
215 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  59.9 
 
 
215 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  59.9 
 
 
216 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  59.9 
 
 
215 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  59.9 
 
 
216 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  64.14 
 
 
245 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  59.38 
 
 
216 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  57.14 
 
 
222 aa  244  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  60.3 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  53.52 
 
 
216 aa  218  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  46.34 
 
 
225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  50.26 
 
 
209 aa  210  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  46.63 
 
 
217 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  49.74 
 
 
209 aa  197  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  52.85 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  54.59 
 
 
226 aa  195  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4012  hypothetical protein  53.95 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000640772 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  45.87 
 
 
229 aa  192  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  46.57 
 
 
216 aa  188  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  42.64 
 
 
232 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  42.79 
 
 
209 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  42.79 
 
 
209 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  43.56 
 
 
217 aa  174  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  36 
 
 
235 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  39.5 
 
 
253 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1893  hypothetical protein  41.58 
 
 
217 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0372929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  35.35 
 
 
240 aa  154  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  39.59 
 
 
252 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  38.5 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  38 
 
 
257 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  36.14 
 
 
258 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  34.83 
 
 
234 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1497  hypothetical protein  40.2 
 
 
238 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000491692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  38.12 
 
 
267 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  36.27 
 
 
265 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  37.13 
 
 
261 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  38.05 
 
 
265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  35.61 
 
 
268 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  39.6 
 
 
265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  37.37 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  33.33 
 
 
235 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  38.19 
 
 
245 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  35.85 
 
 
258 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  36.63 
 
 
261 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  34.17 
 
 
223 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  35.85 
 
 
258 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  33.33 
 
 
235 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  34.63 
 
 
281 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  34.63 
 
 
281 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  36.23 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  34.52 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  41.62 
 
 
219 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  33.5 
 
 
230 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  35.68 
 
 
236 aa  137  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  33 
 
 
270 aa  137  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  36.22 
 
 
203 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  33.65 
 
 
255 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  35.96 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  34.8 
 
 
210 aa  134  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  37.13 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  36.18 
 
 
244 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  36.92 
 
 
196 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  36.1 
 
 
244 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  37.07 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  35.35 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  37.44 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  34.33 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0736  hypothetical protein  36.59 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  35.61 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  35.61 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  34.98 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  34.62 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  33.83 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  35.38 
 
 
219 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.717377 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>