155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0607 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  31.38 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  31.73 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  35.08 
 
 		 190 aa  101  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  32 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  31.03 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  31.89 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  32.99 
 
 		 201 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  31.34 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  31.31 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  33.16 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  31.41 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  32.98 
 
 		 186 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  31.48 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  27.64 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  27.72 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  31.31 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  30.56 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  30.73 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  30.95 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  30.3 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  30.21 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  32.64 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  32.64 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  31.25 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  29.17 
 
 		 200 aa  85.5  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  32.43 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  29.74 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  31.36 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  31.61 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  30.35 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  28.83 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  30.65 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  31.86 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  29.41 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  28.87 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  32.04 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  28.87 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  25 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  27 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  27.96 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  32.12 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  26.39 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  29.35 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  30.14 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  30.21 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  28.99 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  31.84 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  26.18 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  26.4 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  27.32 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  24.76 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  27.92 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  29.56 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  27.92 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  27.92 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  31.61 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  27.41 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  26.77 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  27.86 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  27.86 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  28.5 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  31.25 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  32.5 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  25.25 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  28.21 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  27.41 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  28.35 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  26.9 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  25.87 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  29.95 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4012  hypothetical protein  27.85 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000640772 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  30.89 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  25.38 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1893  hypothetical protein  26.63 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0372929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  27.98 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  26.51 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  25.11 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  27.84 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  26.27 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  29.08 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  23.61 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  26.27 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  27.5 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  30.65 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  28.49 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  24.76 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  26.04 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  24.1 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  27.88 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>