142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1038 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  58.46 
 
 
213 aa  224  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  48.48 
 
 
198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  48.22 
 
 
201 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  43.15 
 
 
205 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  41.87 
 
 
219 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  36 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  39.09 
 
 
192 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  34.58 
 
 
243 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  36.55 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  34.54 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  31.77 
 
 
186 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  33.83 
 
 
197 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  28.87 
 
 
198 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  32.72 
 
 
230 aa  94.7  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  29.5 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  31.69 
 
 
190 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  31.79 
 
 
196 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  29.47 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  29.51 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  31.44 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  29.1 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  29.1 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  28.34 
 
 
193 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  28.42 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  28.42 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  28.42 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  26.11 
 
 
190 aa  79  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  28.8 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  28.26 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  31.22 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  27.13 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  29.02 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  27.23 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  28 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  27.5 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  27.41 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  27.98 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  27.98 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  24.65 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  27.41 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  27.04 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  27.84 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  27.84 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  27.04 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  27.04 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  27.04 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  27.04 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  27.04 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  27.04 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  27.98 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  27.41 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  27.55 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  29.17 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  27.55 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  27.41 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  26.53 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  26.84 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  28.12 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  30.85 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  27.66 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  24.41 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  29.29 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  25.52 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  27.27 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  29.38 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  26.34 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  24.89 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  27.13 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  27.36 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  27.51 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  28.36 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  27.51 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  24.89 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  27.13 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01799  hypothetical protein  27.71 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  27.08 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  26.57 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  23.44 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  25.74 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  29.9 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  25.13 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  23.44 
 
 
219 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  29.8 
 
 
267 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  27.59 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  25.38 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  24.47 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0702  hypothetical protein  28.68 
 
 
215 aa  58.9  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.368955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_861  hypothetical protein  23.94 
 
 
214 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0205305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  27.92 
 
 
225 aa  58.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  27.59 
 
 
234 aa  58.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  27.07 
 
 
231 aa  58.2  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  27.07 
 
 
231 aa  58.2  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  27.64 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  28.06 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  28.71 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  25.76 
 
 
235 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>