151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3463 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  46.39 
 
 		 193 aa  177  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  37.56 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  35.15 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  40.96 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  35.61 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  39.36 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  36 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  39.25 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  32.09 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  29.08 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  29.5 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  33.67 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  30.85 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  30.69 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  31.64 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  25.26 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  25.26 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  26.09 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  28.42 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  28.42 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  25.64 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  28.42 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  28.42 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  25.13 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  28.8 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  27.87 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  24.87 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  29.47 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  29.35 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  26.9 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  31.25 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  27.32 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  24.87 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  27.5 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  23.86 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  25.89 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  24.37 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  23.86 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  26.18 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  27.32 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  25.52 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  25.54 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  23.86 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  29.73 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  29.73 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  24.39 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  26.15 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  29.17 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  21.7 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  29.02 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  30.14 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  31.69 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  31.69 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  24.23 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  24.46 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  25.54 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  27.01 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  24.49 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  30.89 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  26.32 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  23.9 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  25.81 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  24.52 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  24.87 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  25.4 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  26.24 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  27.42 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  24.87 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  25.63 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  24.74 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  24.23 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  24.23 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  24.23 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  23.91 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  24.74 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  24.51 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  23.86 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  23.7 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  26.97 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  26.4 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  24.74 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  23.5 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  23.89 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  23.04 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  24.73 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  21.51 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  23.37 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  23.37 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>