164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0880 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  427  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  86.45 
 
 
214 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_861  hypothetical protein  89.25 
 
 
214 aa  363  1e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  40.31 
 
 
219 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  40.74 
 
 
202 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1084  hypothetical protein  41.36 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  38.54 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  37.5 
 
 
196 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  38.78 
 
 
204 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  35.2 
 
 
208 aa  131  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  35.08 
 
 
203 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  34.38 
 
 
229 aa  128  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  36.92 
 
 
209 aa  127  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  34.54 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  35.05 
 
 
206 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  32.31 
 
 
249 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  33.5 
 
 
200 aa  122  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  31.98 
 
 
232 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  32.16 
 
 
217 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  32.16 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  33.84 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  32.14 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  32.14 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  31.98 
 
 
270 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  31.63 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  32.65 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  32.65 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  31.96 
 
 
216 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  34.85 
 
 
223 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  31.96 
 
 
215 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  31.96 
 
 
215 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  31.96 
 
 
216 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  31.96 
 
 
215 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  31.96 
 
 
216 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  33.33 
 
 
219 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  31.96 
 
 
216 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  32.84 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  32.24 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  35.68 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  31.44 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  32.66 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  36.41 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  32.07 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  32.66 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  31.96 
 
 
216 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  30.88 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  32.34 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  31.96 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  32.34 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  32.29 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  31.96 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  32.99 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  33.5 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  34.5 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  33.01 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  31.98 
 
 
209 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  32.47 
 
 
210 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  30.92 
 
 
268 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  31.53 
 
 
281 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  31.53 
 
 
281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  31.16 
 
 
257 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  31.88 
 
 
244 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  34 
 
 
235 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  31.84 
 
 
265 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  33.67 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  33.33 
 
 
255 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  32.49 
 
 
207 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  32.84 
 
 
219 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  31.86 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  33.01 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  31.88 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  33.01 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  30.65 
 
 
256 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  28.78 
 
 
265 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  31.4 
 
 
245 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  29.7 
 
 
252 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  31.88 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  31.28 
 
 
254 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  29.5 
 
 
217 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  30.3 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  31.53 
 
 
250 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  31.84 
 
 
236 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  30.2 
 
 
253 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  33.17 
 
 
212 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  31.63 
 
 
222 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  33.02 
 
 
216 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  32 
 
 
255 aa  105  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  36.73 
 
 
226 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  29.86 
 
 
244 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  30.7 
 
 
235 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  30.7 
 
 
235 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0736  hypothetical protein  36.47 
 
 
235 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  31.6 
 
 
265 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  33.17 
 
 
245 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  34.13 
 
 
219 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4012  hypothetical protein  30.54 
 
 
219 aa  99  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000640772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>