155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1084 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  40.1 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  41.36 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_861  hypothetical protein  39.69 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  39.55 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  34.85 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  35.75 
 
 		 203 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  34.95 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  35.9 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  33.33 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  33.33 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  33.49 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  34.72 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  33.17 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  34 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  31.28 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  34.43 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  31.92 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  33.33 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  33.97 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  33.83 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  34.2 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  31.47 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  31.03 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  31.79 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  31.79 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  30.95 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  32.82 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  29.74 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  32.08 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  31.6 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  29.72 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  31.75 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  31.6 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  35.92 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  31.6 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  30.2 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  29.49 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  29.8 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  31.07 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  33.02 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  31.07 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  31.82 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  33.49 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  29.38 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  31.31 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  32.32 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  32.43 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  32.43 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  31.74 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  28.85 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  31.66 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  30.05 
 
 		 265 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  29.38 
 
 		 235 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  29.9 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  30.29 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  27.4 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  30.77 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  27.78 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  30.26 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  30.26 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  30.57 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  30.57 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  30.57 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  30.57 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  30.57 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  30.57 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  27.83 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  31.09 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  29.9 
 
 		 268 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  32.86 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  30.57 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  29.47 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  30.69 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  31.09 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  31.09 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  28.35 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1335  hypothetical protein  32.85 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  30.15 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  29.13 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00071  hypothetical protein  32.85 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  30.05 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  29.9 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  29.06 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  29.9 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  29.9 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  29.06 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  27.96 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  29.17 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  27.59 
 
 		 270 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01799  hypothetical protein  34.04 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  29.15 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00081  hypothetical protein  30.48 
 
 		 249 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  30.69 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  28.14 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00071  hypothetical protein  31.55 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  29.58 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>