153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1141 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  35.79 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  37.37 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  39.68 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  36.84 
 
 		 186 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  36.06 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  37.04 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  34.9 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  31.75 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  31.16 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  31.12 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  32.98 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  31.58 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  27.44 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  34.03 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  32.49 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  35.08 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  32.49 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  31.94 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  33.82 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  31.58 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  29.8 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  31.58 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  31.68 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  29.38 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  32.7 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  33.16 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  32.31 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  31.51 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  29.67 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  25.84 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  28.08 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  29.59 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  29 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  28.04 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  30.05 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  27.08 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  30.5 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  29.17 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  27.55 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  28.04 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  26.17 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  26.42 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  26.7 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  26.9 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  30.53 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  29.7 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  26.19 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  32.98 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  26.76 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  26.29 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  27.1 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1664  hypothetical protein  26.73 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  26.77 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  26.9 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1878  protein of unknown function DUF502  26.7 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  30.69 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  25.84 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  30.69 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  28.92 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  27.14 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  32.98 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  31.61 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  31.05 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  31.05 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  30.53 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  29.74 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  31.22 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  30.69 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  30.53 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  30.16 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  30.53 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  30.16 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  30.16 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  30.16 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  30.16 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  30.16 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4671  protein of unknown function DUF502  25.46 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  25.46 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  25.46 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  26.94 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  26.94 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1260  protein of unknown function DUF502  26.73 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.633328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  24.02 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  27.96 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  30.16 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  26.63 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  23.33 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7052  protein of unknown function DUF502  24.89 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6256  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802451  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  27.78 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  23.38 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  23.48 
 
 		 270 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  24.75 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  26.63 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  24.75 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>