151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2706 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2706  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1102  protein of unknown function DUF502  69.5 
 
 		 205 aa  298  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.771192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0268  hypothetical protein  45.18 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.130221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1038  hypothetical protein  41.87 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2258  protein of unknown function DUF502  40.1 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.260414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0143  hypothetical protein  41.21 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3463  hypothetical protein  35.61 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.286648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0054  hypothetical protein  42.16 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.473477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1357  hypothetical protein  37.61 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0363  hypothetical protein  35.9 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  38.86 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  33.84 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  30.05 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  31.53 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3031  protein of unknown function DUF502  32.35 
 
 		 197 aa  95.5  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.21839  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5011  protein of unknown function DUF502  32.66 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1869  protein of unknown function DUF502  30.59 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  29.08 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0164  hypothetical protein  31.84 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  27.55 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2747  hypothetical protein  31.79 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  25 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1141  protein of unknown function DUF502  30.43 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280818  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  28.29 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0607  protein of unknown function DUF502  30.22 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0446  hypothetical protein  30.22 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  29.23 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  26.8 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  26.8 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  27.56 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  28.36 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  27.64 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  27.78 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  27.72 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  29.27 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  25.68 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2580  hypothetical protein  28.29 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1412  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.0206286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  26.73 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  29.29 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  26.83 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  25.5 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  28.28 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  28.42 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  25.12 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  25.12 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  24.88 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  23.18 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2720  hypothetical protein  27.05 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  25.12 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  25.77 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  24.41 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0976  protein of unknown function DUF502  27.08 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1736  hypothetical protein  26.57 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2620  hypothetical protein  26.57 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000120767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  27.78 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  25.94 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  25.79 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2553  hypothetical protein  26.57 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000546469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  22.83 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1440  hypothetical protein  28.79 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  25.5 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  26.5 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  24.88 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  24.76 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  21.83 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1622  hypothetical protein  29.21 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.267647  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  25.74 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  26.32 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  23.11 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1361  hypothetical protein  27.64 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  23.44 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  22.89 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  22.82 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  29.63 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  26.83 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  23.72 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1260  protein of unknown function DUF502  27.27 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.633328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  24.62 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1260  protein of unknown function DUF502  24 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  25.62 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1545  hypothetical protein  26.53 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  25.62 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  25.62 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2805  protein of unknown function DUF502  26.53 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1575  hypothetical protein  26.53 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2920  protein of unknown function DUF502  30.56 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1541  hypothetical protein  26.53 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  25.12 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  25.35 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  25.85 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  23.86 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>