153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2920 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2920  protein of unknown function DUF502  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  74.45 
 
 
235 aa  344  5e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  74.45 
 
 
235 aa  344  6e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01799  hypothetical protein  81.12 
 
 
196 aa  327  7e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  32.84 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  31.71 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  34.93 
 
 
232 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  30.88 
 
 
214 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  32.31 
 
 
196 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  31.79 
 
 
196 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6053  hypothetical protein  31.9 
 
 
216 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  32.86 
 
 
255 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0377  hypothetical protein  33.18 
 
 
235 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  33.81 
 
 
218 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  30 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2114  hypothetical protein  31.9 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2726  hypothetical protein  31.9 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0409906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  32.69 
 
 
216 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  32.69 
 
 
216 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2405  hypothetical protein  32.69 
 
 
216 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  31.43 
 
 
209 aa  98.2  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  31.43 
 
 
209 aa  98.2  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1789  protein of unknown function DUF502  33.18 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.858117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  33.17 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  33.17 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  33.17 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0573  hypothetical protein  31.25 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110899  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2753  hypothetical protein  31.73 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0641592  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0559  hypothetical protein  31.73 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0655  protein of unknown function DUF502  31.92 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  33.18 
 
 
243 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2777  hypothetical protein  31.73 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2644  hypothetical protein  31.73 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  31.46 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  34 
 
 
219 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  32.86 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  32.08 
 
 
206 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  31.13 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  31.13 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  31.13 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  32.7 
 
 
245 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  32.7 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  30.37 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  29.86 
 
 
200 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  31.13 
 
 
244 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12550  hypothetical protein  31.19 
 
 
204 aa  92  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5040  protein of unknown function DUF502  30.37 
 
 
255 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.226828 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  30.23 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  29.61 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  31.09 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  30.62 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  32.13 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  28.64 
 
 
217 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0602  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  89  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.880988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  29.67 
 
 
270 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  30.58 
 
 
229 aa  88.6  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  37.5 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0702  hypothetical protein  24.75 
 
 
215 aa  85.5  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.368955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  29.61 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  29.76 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1497  hypothetical protein  38.33 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000491692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0736  hypothetical protein  35.17 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  33.77 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  30.23 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1335  hypothetical protein  31.9 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  34.03 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  34.03 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00071  hypothetical protein  31.9 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0438  hypothetical protein  31.42 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  27.48 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  29.77 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  31.58 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1479  protein of unknown function DUF502  29.58 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1453  protein of unknown function DUF502  29.58 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00081  hypothetical protein  31.13 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1727  protein of unknown function DUF502  27.43 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928389  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1911  protein of unknown function DUF502  27.23 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  27.75 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2681  hypothetical protein  34.22 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0401595  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_861  hypothetical protein  27.8 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0205305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1152  hypothetical protein  27.18 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000214061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1084  hypothetical protein  33.07 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1878  protein of unknown function DUF502  26.5 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  36.09 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  30.33 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00071  hypothetical protein  30.99 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473794 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  26.54 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  29.38 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1039  hypothetical protein  28.28 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1880  protein of unknown function DUF502  26.9 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000754337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  27.83 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  30.41 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  27.01 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1402  hypothetical protein  29.68 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  27.62 
 
 
223 aa  72  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  26.83 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2407  protein of unknown function DUF502  29.95 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  27.4 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  29.66 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>