More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0080 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0080  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 779 aa  1562    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 995 aa  243  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 1068 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 846 aa  233  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.52 
 
 		 1560 aa  229  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  32.11 
 
 		 987 aa  227  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.72 
 
 		 751 aa  226  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  30.37 
 
 		 982 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 957 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 817 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 687 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 1157 aa  224  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  30.82 
 
 		 984 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 530 aa  223  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  33.85 
 
 		 802 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 982 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  34.85 
 
 		 1028 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 827 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 944 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1049 aa  221  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2306  histidine kinase  34.4 
 
 		 479 aa  220  8.999999999999998e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.808548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 631 aa  220  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 827 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  36.75 
 
 		 539 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 1350 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 1407 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 1158 aa  217  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 901 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 524 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.43 
 
 		 779 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 873 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1044 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  34.96 
 
 		 1871 aa  213  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  31.09 
 
 		 968 aa  213  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 695 aa  213  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 865 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1596 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  38.59 
 
 		 868 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.68 
 
 		 823 aa  211  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 862 aa  211  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  33.92 
 
 		 661 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 789 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  31.26 
 
 		 985 aa  212  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  33.92 
 
 		 797 aa  211  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 860 aa  211  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.01 
 
 		 853 aa  211  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.33 
 
 		 785 aa  211  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 1029 aa  211  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 939 aa  211  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.09 
 
 		 1193 aa  211  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 765 aa  211  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.92 
 
 		 779 aa  211  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 910 aa  210  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 873 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 781 aa  210  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 771 aa  210  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 874 aa  210  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  33.66 
 
 		 835 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  29.58 
 
 		 1000 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 903 aa  210  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 984 aa  210  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 940 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1110 aa  209  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 937 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 717 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 572 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 		 1222 aa  209  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 781 aa  208  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 643 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 957 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 870 aa  207  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 1009 aa  207  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  32.94 
 
 		 528 aa  207  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 785 aa  207  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 947 aa  207  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  34.76 
 
 		 786 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  34.67 
 
 		 1023 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 1452 aa  206  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 896 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 1199 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 		 785 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 822 aa  206  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  34.82 
 
 		 578 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 764 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1691 aa  206  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 977 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  34.64 
 
 		 787 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 902 aa  205  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  36.21 
 
 		 900 aa  205  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 1058 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  34.02 
 
 		 697 aa  204  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 863 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 811 aa  204  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 858 aa  204  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 791 aa  204  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 959 aa  204  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 1362 aa  203  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1124 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  32.87 
 
 		 641 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 1223 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>