127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2184 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2184  permease  100 
 
 		 422 aa  838    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  55 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  41.88 
 
 		 413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  41.62 
 
 		 403 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  41.62 
 
 		 402 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  41.37 
 
 		 403 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  41.15 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  40.91 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  39.75 
 
 		 421 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  39.51 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  39.51 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 		 421 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  39.56 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  39.56 
 
 		 411 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  39.56 
 
 		 411 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  39.56 
 
 		 411 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 393 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  39.32 
 
 		 411 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  41.38 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  39.34 
 
 		 380 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  27.61 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  24.94 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  40.48 
 
 		 139 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  26.59 
 
 		 452 aa  99.8  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1891  transporter, major facilitator family  44.19 
 
 		 112 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.55 
 
 		 489 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  22.66 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  37.18 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0623  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  26.57 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.08 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.77 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  22.22 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  23.74 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.77 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  23.74 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  25.55 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  25.55 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  22.6 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  22.6 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  22.6 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.49 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  25.55 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  22.6 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  22.6 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 		 505 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5425  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.460942  normal  0.126626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.93 
 
 		 1833 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  22.6 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.84 
 
 		 521 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.9 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  23.77 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.54 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.88 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21310  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.48 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4805  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675346  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  20.48 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.81 
 
 		 615 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  20.36 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10199  conserved hypothetical protein  31.46 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.09 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.09 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  26.15 
 
 		 495 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  25.79 
 
 		 523 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  20.6 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 522 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.09 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.65 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.73 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.65 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.65 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.65 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>