31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1894 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  100 
 
 		 139 aa  277  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  268  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  100 
 
 		 421 aa  268  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  100 
 
 		 421 aa  268  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  268  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  268  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  99.25 
 
 		 423 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  99.25 
 
 		 421 aa  266  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  99.25 
 
 		 421 aa  266  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  89.57 
 
 		 411 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  89.57 
 
 		 411 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  89.57 
 
 		 411 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  89.57 
 
 		 411 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  88.7 
 
 		 411 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  73.81 
 
 		 422 aa  189  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  40.48 
 
 		 422 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 413 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  41.05 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  39.33 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  40 
 
 		 393 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  40 
 
 		 404 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 404 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  40 
 
 		 404 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  38.95 
 
 		 402 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  38.95 
 
 		 403 aa  70.5  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  38.95 
 
 		 384 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  37.89 
 
 		 380 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  38.95 
 
 		 413 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  38.95 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  34.13 
 
 		 395 aa  63.9  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  38.1 
 
 		 401 aa  57  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>