45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0066 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 401 aa  797    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  34.47 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  30.83 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  30.83 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  29.82 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  30.83 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  30.21 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  30.18 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  30.03 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  29.27 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 421 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  30.17 
 
 		 421 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 421 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  30.17 
 
 		 421 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  30.17 
 
 		 421 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 421 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  28.25 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  28.25 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  28.25 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  28.25 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  28.25 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  27.96 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  27.61 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  26.05 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  31.13 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  38.1 
 
 		 139 aa  57  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  42.42 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  22.94 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  20.42 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  30.68 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  20.84 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  21.17 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  20.42 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1348  arabinose efflux permease  27.5 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0715454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.63 
 
 		 504 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>