43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1382 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  827    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  67.09 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  66.83 
 
 		 403 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  65.53 
 
 		 404 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  65.78 
 
 		 404 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  65.78 
 
 		 404 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  65.78 
 
 		 404 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  65.44 
 
 		 403 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  66.33 
 
 		 402 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  65.59 
 
 		 393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  65.31 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  61.56 
 
 		 380 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  41.71 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  42.19 
 
 		 408 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  36.62 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  36.62 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  36.62 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  36.62 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 422 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 421 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  36.36 
 
 		 411 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  36.27 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  36.27 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  36.27 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  34.16 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  30.54 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  28.06 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  27.85 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  43.75 
 
 		 139 aa  74.7  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1891  transporter, major facilitator family  35.16 
 
 		 112 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.06 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.41 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4075  MFS family transporter  27.66 
 
 		 513 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2560  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>