34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0148 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 395 aa  780    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  34.47 
 
 		 401 aa  229  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  34.88 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  36.18 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  36.18 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  34.64 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  34.88 
 
 		 403 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  35.14 
 
 		 413 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  35.92 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  35 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  33.85 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  35.19 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  31.59 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  31.25 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 421 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  31.25 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  29.53 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  29.53 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  29.53 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  29.53 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  29.28 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 422 aa  163  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  30 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  25.43 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  23.49 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  34.13 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  37.5 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>