37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1771 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  98.73 
 
 
404 aa  781    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  99.49 
 
 
404 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  99.75 
 
 
404 aa  788    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  99.24 
 
 
404 aa  784    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  99.48 
 
 
384 aa  768    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  100 
 
 
393 aa  791    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  78.52 
 
 
413 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  78.52 
 
 
403 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  78.52 
 
 
402 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  78.52 
 
 
403 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  72.89 
 
 
380 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  65.59 
 
 
413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  40.05 
 
 
422 aa  295  8e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  42.86 
 
 
408 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  38.68 
 
 
411 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  38.67 
 
 
411 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  38.68 
 
 
411 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  38.68 
 
 
411 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  38.42 
 
 
411 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  37.07 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  37.07 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  37.07 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  37.07 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  37.07 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  37.07 
 
 
421 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  37.07 
 
 
421 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  35.92 
 
 
395 aa  208  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  30.21 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  27.6 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  37.41 
 
 
452 aa  87  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  40 
 
 
139 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1891  transporter, major facilitator family  42.86 
 
 
112 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
450 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  24.58 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  24.68 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>