33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08740 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 452 aa  902    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  74.23 
 
 		 440 aa  659    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 404 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  27.43 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  27.03 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  27.07 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  27.07 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  26.83 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  26.65 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  27.11 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 384 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  25.18 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  25.3 
 
 		 411 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  25.3 
 
 		 411 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  25.3 
 
 		 411 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  25.55 
 
 		 411 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  23.75 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  23.75 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  23.75 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 421 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  26.2 
 
 		 401 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  33.97 
 
 		 380 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  24.23 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>