76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1457 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1941  major facilitator transporter  78.61 
 
 		 404 aa  634    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923029  hitchhiker  0.000874845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1506  major facilitator family transporter  78.86 
 
 		 404 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340818  hitchhiker  0.000395679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1473  inner membrane transport protein YdiM  98.01 
 
 		 402 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179045 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1952  major facilitator superfamily MFS_1  78.61 
 
 		 404 aa  634    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17424  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1492  inner membrane transport protein YdiM  98.26 
 
 		 403 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  0.0211513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1457  inner membrane transport protein YdiM  100 
 
 		 413 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0786899  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1811  inner membrane transport protein YdiM  99.01 
 
 		 403 aa  799    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1982  inner membrane transport protein YdiM  92.31 
 
 		 380 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218358 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1906  major facilitator family transporter  78.36 
 
 		 404 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1771  major facilitator family transporter  78.52 
 
 		 393 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2406  major facilitator family transporter  78.01 
 
 		 384 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1382  major facilitator superfamily MFS_1  67.09 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2184  permease  41.88 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2189  putative transport system permease protein  42.65 
 
 		 408 aa  312  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1384  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  36.29 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  36.29 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  36.29 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  36.29 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  36.29 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1907  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1772  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1951  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 421 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.214686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2407  transporter, major facilitator family  35.79 
 
 		 421 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.197436 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01649  hypothetical protein  35.79 
 
 		 421 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  35.79 
 
 		 421 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 421 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0148  major facilitator superfamily permease  34.88 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0066  major facilitator superfamily permease  29.82 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.110022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09330  arabinose efflux permease family protein  25.7 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000513104  normal  0.568099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08740  Major Facilitator Superfamily transporter  26.71 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.240638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1894  transporter, major facilitator family  38.95 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1891  transporter, major facilitator family  32.22 
 
 		 112 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  31.25 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  31.25 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  24.83 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  24.49 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  24.49 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  24.49 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  24.49 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 444 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.1 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  24.15 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  40.62 
 
 		 500 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  31.37 
 
 		 500 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  31.37 
 
 		 500 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  25.83 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  30.34 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.59 
 
 		 505 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.88 
 
 		 532 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 398 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  30.39 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  41.82 
 
 		 500 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>