More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2565 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  100 
 
 		 436 aa  846    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  83.92 
 
 		 438 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  96.32 
 
 		 436 aa  813    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  100 
 
 		 436 aa  846    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  49.16 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  45.67 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  45.04 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 		 434 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1862  major facilitator family transporter  45.16 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760818  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1404  major facilitator family transporter  44.91 
 
 		 482 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0766  major facilitator family transporter  45.16 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1266  major facilitator family transporter  45.16 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0383  major facilitator family transporter  45.16 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1100  major facilitator family transporter  45.16 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1258  major facilitator family transporter  44.91 
 
 		 485 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  42.38 
 
 		 443 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  43.5 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  43.2 
 
 		 420 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 445 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2097  general substrate transporter  41.3 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00320357  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 		 433 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55220  MFS family transporter  46.56 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.872465  hitchhiker  0.00000012197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  36.96 
 
 		 431 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  40.18 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  41.65 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  43.09 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 438 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  41.9 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  39.11 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  41.65 
 
 		 437 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.59 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 535 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 435 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  39.42 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  39.72 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  39.42 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  39.42 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  39.42 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  39.72 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  39.42 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  39.42 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  39.72 
 
 		 435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  39.42 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  39.58 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 440 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  41.21 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  39.81 
 
 		 435 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 425 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2370  general substrate transporter  37.27 
 
 		 477 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0903  general substrate transporter  37.27 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  39.81 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0891  general substrate transporter  37.47 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0454  citrate-proten symporter  37.3 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2600  citrate-proton symporter  37.3 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0971  citrate-proton symporter  37.3 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.710178  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0175  citrate-proton symporter  37.3 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.28 
 
 		 433 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1618  citrate-proten symporter  37.04 
 
 		 431 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2968  citrate-proton symporter  37.3 
 
 		 431 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 427 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 437 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2908  citrate-proton symporter  37.06 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3016  citrate-proton symporter  37.06 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.05 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  37.32 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  39.86 
 
 		 430 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  38.61 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>