More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1266 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0766  major facilitator family transporter  99.3 
 
 
438 aa  829    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1266  major facilitator family transporter  100 
 
 
429 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1862  major facilitator family transporter  99.06 
 
 
426 aa  822    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1404  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
482 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  91.19 
 
 
473 aa  735    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0383  major facilitator family transporter  99.3 
 
 
438 aa  829    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1258  major facilitator family transporter  99.53 
 
 
485 aa  830    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1100  major facilitator family transporter  99.3 
 
 
438 aa  829    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55220  MFS family transporter  69.95 
 
 
438 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.872465  hitchhiker  0.00000012197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4806  MFS family transporter  68.99 
 
 
438 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  48.37 
 
 
443 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  46.12 
 
 
438 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  45.97 
 
 
437 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  45.97 
 
 
437 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  45.19 
 
 
443 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  45.99 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  45.15 
 
 
440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  45.43 
 
 
437 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  45.34 
 
 
437 aa  326  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  45.02 
 
 
443 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  45.02 
 
 
443 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  44.69 
 
 
443 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  44.9 
 
 
443 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  45.02 
 
 
443 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  44.26 
 
 
445 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  44.26 
 
 
445 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  44.26 
 
 
445 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  44.26 
 
 
445 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  44.03 
 
 
445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  44.58 
 
 
420 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  43.1 
 
 
438 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  46.15 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  45.26 
 
 
436 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  45.26 
 
 
436 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  42.62 
 
 
438 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  44.15 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  45.41 
 
 
439 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  43.99 
 
 
425 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  42.09 
 
 
448 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  42.79 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  45.19 
 
 
441 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  43.41 
 
 
435 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  43.17 
 
 
435 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  43.17 
 
 
435 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  43.17 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  44.71 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  44.71 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  44.71 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  42.33 
 
 
453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  42.93 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  40.34 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  42.93 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  42.89 
 
 
440 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 
440 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 
438 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  42.21 
 
 
438 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  44.71 
 
 
441 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  41.93 
 
 
439 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
430 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
430 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
430 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
430 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  41.13 
 
 
466 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
430 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
417 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
430 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  42.03 
 
 
440 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 
439 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  41.54 
 
 
442 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 
443 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.26 
 
 
430 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.19 
 
 
435 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  39.32 
 
 
431 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  40.73 
 
 
447 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  41.85 
 
 
431 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  42.93 
 
 
461 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  40.25 
 
 
434 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 
443 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  43.41 
 
 
434 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.6 
 
 
425 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 
427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 
425 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
457 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  42.51 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  41.05 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  39.32 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2097  general substrate transporter  41.25 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00320357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  38.08 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  38.12 
 
 
438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  39.16 
 
 
442 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  40.99 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  38.12 
 
 
438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.34 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  39.55 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  40.99 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  43.14 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>