69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1107 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1107  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 501 aa  1013    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192889  normal  0.929287 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0525  extracellular solute-binding protein family 1  28.51 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180437  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1181  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 490 aa  127  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.595766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.46 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.68 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  20.29 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  21.7 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  20.61 
 
 		 522 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  19.3 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 449 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  21.31 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  19.81 
 
 		 433 aa  51.2  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 443 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 443 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  19.43 
 
 		 452 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 411 aa  50.4  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.87 
 
 		 425 aa  50.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  20.45 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 439 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  21.45 
 
 		 484 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 413 aa  47.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1115  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000327347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  20.51 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  20.73 
 
 		 412 aa  43.5  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  26.06 
 
 		 464 aa  43.5  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 414 aa  43.5  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>