30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1181 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1181  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 490 aa  991    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.595766 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0525  extracellular solute-binding protein family 1  50.11 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180437  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1107  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 501 aa  137  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192889  normal  0.929287 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.71 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  20.09 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 487 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  20 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 467 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.07 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3333  transporter, putative  22.41 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  20.96 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.57 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 484 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>