More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1288 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01822  phosphogluconate dehydratase  63.79 
 
 		 603 aa  798    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1790  6-phosphogluconate dehydratase  63.79 
 
 		 603 aa  798    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00020158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1048  phosphogluconate dehydratase  87.34 
 
 		 608 aa  1110    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1010  phosphogluconate dehydratase  87.34 
 
 		 608 aa  1110    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1476  phosphogluconate dehydratase  60.35 
 
 		 623 aa  774    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0037  phosphogluconate dehydratase  59.97 
 
 		 609 aa  738    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1560  phosphogluconate dehydratase  62.79 
 
 		 609 aa  767    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3765  phosphogluconate dehydratase  55.52 
 
 		 608 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2283  phosphogluconate dehydratase  61.42 
 
 		 604 aa  772    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.348239  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1271  phosphogluconate dehydratase  54.32 
 
 		 600 aa  687    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2487  phosphogluconate dehydratase  61.02 
 
 		 608 aa  771    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1288  6-phosphogluconate dehydratase  100 
 
 		 608 aa  1251    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3524  phosphogluconate dehydratase  62.21 
 
 		 616 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0350614  normal  0.499823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2723  phosphogluconate dehydratase  62.62 
 
 		 618 aa  784    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4214  phosphogluconate dehydratase  88.82 
 
 		 608 aa  1125    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2446  phosphogluconate dehydratase  63.35 
 
 		 617 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0485  phosphogluconate dehydratase  57.07 
 
 		 612 aa  718    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0461  phosphogluconate dehydratase  57.57 
 
 		 612 aa  718    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1109  phosphogluconate dehydratase  98.85 
 
 		 608 aa  1241    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1080  phosphogluconate dehydratase  61.9 
 
 		 604 aa  785    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00217258  hitchhiker  0.0000000267621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1081  phosphogluconate dehydratase  60.73 
 
 		 623 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5330  phosphogluconate dehydratase  59.5 
 
 		 611 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7067  phosphogluconate dehydratase  61.69 
 
 		 610 aa  772    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2239  phosphogluconate dehydratase  61.37 
 
 		 608 aa  769    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0583467  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1868  phosphogluconate dehydratase  60.69 
 
 		 613 aa  767    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3442  phosphogluconate dehydratase  62.93 
 
 		 617 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4375  phosphogluconate dehydratase  86.35 
 
 		 608 aa  1092    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1303  phosphogluconate dehydratase  58.76 
 
 		 601 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3746  phosphogluconate dehydratase  62.96 
 
 		 618 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3958  phosphogluconate dehydratase  60.73 
 
 		 607 aa  751    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1009  phosphogluconate dehydratase  87.34 
 
 		 608 aa  1111    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.241046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1440  phosphogluconate dehydratase  60.33 
 
 		 608 aa  735    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1336  phosphogluconate dehydratase  63.79 
 
 		 603 aa  798    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2081  phosphogluconate dehydratase  63.79 
 
 		 603 aa  798    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1582  phosphogluconate dehydratase  60.84 
 
 		 618 aa  777    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1217  phosphogluconate dehydratase  63.18 
 
 		 617 aa  777    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.890922  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1895  phosphogluconate dehydratase  57.55 
 
 		 606 aa  703    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.488647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1953  phosphogluconate dehydratase  56.52 
 
 		 601 aa  697    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0750958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1698  phosphogluconate dehydratase  63.41 
 
 		 617 aa  786    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.390811  hitchhiker  0.0000236515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2060  phosphogluconate dehydratase  56.7 
 
 		 616 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1381  phosphogluconate dehydratase  58.4 
 
 		 609 aa  730    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0730  phosphogluconate dehydratase  60.59 
 
 		 576 aa  724    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0759  phosphogluconate dehydratase  55.79 
 
 		 624 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0364344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1624  phosphogluconate dehydratase  58 
 
 		 606 aa  696    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3551  phosphogluconate dehydratase  59.01 
 
 		 605 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.952112  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0589  phosphogluconate dehydratase  61.23 
 
 		 634 aa  751    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2077  phosphogluconate dehydratase  60.53 
 
 		 608 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1943  phosphogluconate dehydratase  63.79 
 
 		 603 aa  796    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0936  phosphogluconate dehydratase  65.16 
 
 		 623 aa  790    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1045  phosphogluconate dehydratase  60 
 
 		 629 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00269183  normal  0.140285 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5802  phosphogluconate dehydratase  60.3 
 
 		 700 aa  743    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2420  phosphogluconate dehydratase  62.13 
 
 		 603 aa  777    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2132  phosphogluconate dehydratase  60.53 
 
 		 608 aa  767    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0124289  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0376  phosphogluconate dehydratase  57.55 
 
 		 603 aa  712    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0191  phosphogluconate dehydratase  55.88 
 
 		 663 aa  671    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.970836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0177  phosphogluconate dehydratase  62.13 
 
 		 618 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3428  phosphogluconate dehydratase  57.78 
 
 		 608 aa  710    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0972  phosphogluconate dehydratase  61.73 
 
 		 607 aa  781    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.798865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0157  phosphogluconate dehydratase  61.01 
 
 		 604 aa  762    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2632  phosphogluconate dehydratase  63.35 
 
 		 617 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2044  phosphogluconate dehydratase  61.02 
 
 		 608 aa  770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.747422  normal  0.183886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1931  phosphogluconate dehydratase  61.35 
 
 		 608 aa  773    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0231353  normal  0.168183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1894  phosphogluconate dehydratase  60.36 
 
 		 608 aa  760    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0371  phosphogluconate dehydratase  54.96 
 
 		 638 aa  689    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2640  phosphogluconate dehydratase  61.72 
 
 		 618 aa  729    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0555  phosphogluconate dehydratase  62.46 
 
 		 618 aa  777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22910  phosphogluconate dehydratase  76.56 
 
 		 608 aa  964    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.404341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2007  phosphogluconate dehydratase  58.35 
 
 		 609 aa  722    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.691716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2537  phosphogluconate dehydratase  61.22 
 
 		 608 aa  774    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.449195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0466  phosphogluconate dehydratase  58.53 
 
 		 604 aa  713    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0660  phosphogluconate dehydratase  62.13 
 
 		 618 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2333  phosphogluconate dehydratase  59.87 
 
 		 608 aa  763    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.480587  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2149  phosphogluconate dehydratase  61.35 
 
 		 608 aa  773    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00662337  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2046  phosphogluconate dehydratase  61.49 
 
 		 608 aa  768    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.26142 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3442  phosphogluconate dehydratase  63.1 
 
 		 617 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1955  phosphogluconate dehydratase  57.26 
 
 		 600 aa  702    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80923  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7021  phosphogluconate dehydratase  61.69 
 
 		 610 aa  772    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1810  phosphogluconate dehydratase  63.04 
 
 		 608 aa  772    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1018  phosphogluconate dehydratase  63.41 
 
 		 619 aa  785    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2177  phosphogluconate dehydratase  60.69 
 
 		 608 aa  769    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.318983  hitchhiker  0.00331575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2072  phosphogluconate dehydratase  61.06 
 
 		 608 aa  768    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.013535  normal  0.010914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1830  phosphogluconate dehydratase  62.23 
 
 		 606 aa  765    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.511602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1781  phosphogluconate dehydratase  63.62 
 
 		 603 aa  795    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2793  phosphogluconate dehydratase  56.84 
 
 		 617 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.601068  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1312  phosphogluconate dehydratase  82.7 
 
 		 607 aa  1037    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.19652  normal  0.978584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2986  phosphogluconate dehydratase  56.37 
 
 		 613 aa  656    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65391  normal  0.0634234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4499  phosphogluconate dehydratase  62.54 
 
 		 604 aa  763    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1181  phosphogluconate dehydratase  58.93 
 
 		 601 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2049  phosphogluconate dehydratase  57.85 
 
 		 605 aa  685    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0575852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0363  phosphogluconate dehydratase  63.35 
 
 		 617 aa  778    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2570  phosphogluconate dehydratase  53.24 
 
 		 593 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0376313  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1791  phosphogluconate dehydratase  60.35 
 
 		 623 aa  775    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.563758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1727  phosphogluconate dehydratase  58 
 
 		 606 aa  695    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3407  phosphogluconate dehydratase  63.1 
 
 		 617 aa  780    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0298  phosphogluconate dehydratase  58.6 
 
 		 606 aa  741    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1934  phosphogluconate dehydratase  76.23 
 
 		 608 aa  961    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.976581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1221  phosphogluconate dehydratase  63.35 
 
 		 617 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1769  phosphogluconate dehydratase  58.25 
 
 		 601 aa  689    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.618197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0627  phosphogluconate dehydratase  62.46 
 
 		 618 aa  775    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4525  phosphogluconate dehydratase  61.37 
 
 		 608 aa  769    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>