279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30270 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  100 
 
 		 337 aa  691    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  34.37 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  31.79 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  30.28 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  30.51 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  31.58 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  30.34 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  29.1 
 
 		 325 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  29.23 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  29.38 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  30.77 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  27.73 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  29.08 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  28.48 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  25.77 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  26.52 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  26.91 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  26.69 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  24.38 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  26.38 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  27.37 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  26.13 
 
 		 381 aa  85.9  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  24.12 
 
 		 1230 aa  79.7  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  22.49 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  24.32 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  22.22 
 
 		 1251 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2048  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.51 
 
 		 614 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.89 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  24.07 
 
 		 1243 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  22.77 
 
 		 1240 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  24.36 
 
 		 1251 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  24.43 
 
 		 1251 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  23.5 
 
 		 1244 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  25.14 
 
 		 813 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  24.48 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  23.39 
 
 		 804 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  22.85 
 
 		 804 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  20.86 
 
 		 1232 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  23.34 
 
 		 1227 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  23.44 
 
 		 1238 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3617  methionine synthase (B12-dependent)  24.36 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732066  normal  0.0126884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  23.56 
 
 		 1264 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  21.84 
 
 		 1246 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  23.56 
 
 		 1264 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3347  methionine synthase (B12-dependent)  23.85 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  22.74 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  21.39 
 
 		 1244 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2998  methionine synthase  23.85 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639431  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  22.83 
 
 		 1245 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  21.39 
 
 		 1244 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1689  homocysteine S-methyltransferase  22.95 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1980  methionine synthase  23.03 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  24.93 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  24.19 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  23.67 
 
 		 1225 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2437  methionine synthase (B12-dependent)  23.05 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  21.39 
 
 		 1244 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  21.7 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  23.77 
 
 		 1245 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  23.3 
 
 		 1220 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  21.39 
 
 		 1226 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  22.44 
 
 		 1274 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  20.83 
 
 		 1244 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1433  methionine synthase I, homocysteine S-methyltransferase  23.1 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3657  methionine synthase  23.78 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  22.7 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  25.3 
 
 		 811 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  20.23 
 
 		 1241 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  21.75 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.48 
 
 		 1132 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  24 
 
 		 1176 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  20.9 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  21.32 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  22.92 
 
 		 1269 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  23.82 
 
 		 804 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  24.4 
 
 		 819 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  22.87 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  22.54 
 
 		 1228 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  24.2 
 
 		 807 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  20.34 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.39 
 
 		 1226 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  20.34 
 
 		 1244 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  22.13 
 
 		 1278 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  20.46 
 
 		 1238 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  22.85 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2611  homocysteine S-methyltransferase  22.04 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  20.8 
 
 		 1252 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  24.35 
 
 		 1132 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.26 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  20.56 
 
 		 1233 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.89 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.12 
 
 		 617 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  23.28 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  22.48 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3268  homocysteine S-methyltransferase  22.67 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  23.6 
 
 		 1224 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  22.22 
 
 		 1249 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  20.28 
 
 		 1244 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  22.32 
 
 		 1263 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  23.05 
 
 		 768 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>