More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1146 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  100 
 
 
319 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  61.84 
 
 
313 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  57.93 
 
 
312 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  60.2 
 
 
315 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  59.09 
 
 
310 aa  344  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  58.17 
 
 
311 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  58.88 
 
 
325 aa  338  7e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  50.64 
 
 
325 aa  309  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  51.61 
 
 
316 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  45.05 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  44.41 
 
 
311 aa  271  9e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  50.33 
 
 
287 aa  255  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  43.96 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  50.68 
 
 
288 aa  248  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  43.91 
 
 
316 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  48.29 
 
 
295 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  45.79 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  46.6 
 
 
320 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  47.67 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  42.44 
 
 
314 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  29.23 
 
 
337 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  31.55 
 
 
418 aa  135  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  33.55 
 
 
615 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  28.9 
 
 
819 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  32.25 
 
 
629 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.1 
 
 
605 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.3 
 
 
605 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  29.49 
 
 
304 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.8 
 
 
609 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  32.48 
 
 
305 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.8 
 
 
605 aa  99.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  29.26 
 
 
807 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  28.35 
 
 
310 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  30.74 
 
 
800 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  28.73 
 
 
355 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  31.63 
 
 
804 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.3 
 
 
610 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  30.72 
 
 
813 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  28.95 
 
 
1228 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  28.75 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.1 
 
 
610 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.77 
 
 
617 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  31.55 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  29.88 
 
 
1227 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  30.72 
 
 
300 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  25.23 
 
 
381 aa  89  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  32.37 
 
 
300 aa  89  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.81 
 
 
604 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  29.49 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  29.77 
 
 
811 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  26.42 
 
 
1180 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  31.35 
 
 
818 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  30.56 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  30.09 
 
 
300 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  29.81 
 
 
806 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3952  methionine synthase I  31.92 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225692  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  32.13 
 
 
801 aa  86.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  27.42 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  27.65 
 
 
1249 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  30.65 
 
 
1271 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  27.76 
 
 
768 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  29.97 
 
 
804 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  27.46 
 
 
1225 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0843  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.46 
 
 
611 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  29.07 
 
 
804 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  29.08 
 
 
804 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  27.76 
 
 
768 aa  82.4  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  27.93 
 
 
358 aa  82.4  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  29.03 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  29.18 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  27.92 
 
 
802 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  29.04 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  28.27 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  28.49 
 
 
1236 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  27.33 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0115  homocysteine S-methyltransferase  28.18 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.165107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.75 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  29.74 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  28.98 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  28.04 
 
 
1272 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  28.92 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  28.92 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  27.22 
 
 
1229 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0460  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.41 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  28.7 
 
 
1238 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  24.42 
 
 
804 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  29.52 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  31.33 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  28.74 
 
 
1274 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  28.92 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1433  methionine synthase I, homocysteine S-methyltransferase  29.25 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  28.62 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3657  methionine synthase  27.91 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.15726 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  28.92 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>