More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1508 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 334 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  66.96 
 
 		 1274 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  66.36 
 
 		 1261 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1433  methionine synthase I, homocysteine S-methyltransferase  67.69 
 
 		 338 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  61.52 
 
 		 1263 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  60.79 
 
 		 1236 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  61.21 
 
 		 1235 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  61.09 
 
 		 1278 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  61.21 
 
 		 1235 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  60.18 
 
 		 1267 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  61.21 
 
 		 1235 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  60.61 
 
 		 1235 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.74 
 
 		 1239 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  59.94 
 
 		 1226 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  60.12 
 
 		 1239 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  58.79 
 
 		 1271 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  59.88 
 
 		 1236 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  58.66 
 
 		 1219 aa  418  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  59.27 
 
 		 1226 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  60.55 
 
 		 1250 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  60.61 
 
 		 1272 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  58.9 
 
 		 1236 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  58.66 
 
 		 1234 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  60.68 
 
 		 1293 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  61.54 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  58.05 
 
 		 1245 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  60.86 
 
 		 1226 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  58.66 
 
 		 1234 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  58.72 
 
 		 1227 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  61.54 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  58.1 
 
 		 1226 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  59.5 
 
 		 1271 aa  412  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  61.85 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  58.97 
 
 		 1271 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  61.54 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  61.85 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  61.54 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  57.75 
 
 		 1227 aa  411  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  57.49 
 
 		 1232 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  58.1 
 
 		 1232 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  60.92 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2611  homocysteine S-methyltransferase  55.88 
 
 		 363 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186281 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  57.32 
 
 		 1245 aa  408  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  60.18 
 
 		 1237 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  58.13 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  55.72 
 
 		 1227 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  56.29 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  59.13 
 
 		 1230 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  58.66 
 
 		 1227 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  59.51 
 
 		 356 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  58.66 
 
 		 1227 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  56.33 
 
 		 1225 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  60.26 
 
 		 1238 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  58.66 
 
 		 1227 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  58.46 
 
 		 1245 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  58.66 
 
 		 1227 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  58.95 
 
 		 1249 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  57.32 
 
 		 1237 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.66 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  59.33 
 
 		 1246 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  59.56 
 
 		 1220 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.66 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.66 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.66 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  59.38 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  57.27 
 
 		 1233 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  59.34 
 
 		 1226 aa  398  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1227 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  57.91 
 
 		 1244 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.66 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  58.66 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  57.23 
 
 		 1220 aa  398  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  57.49 
 
 		 1244 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  59.08 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  59.75 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  57.19 
 
 		 1244 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  57.49 
 
 		 1244 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  55.69 
 
 		 1232 aa  394  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  57.14 
 
 		 1227 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  56.89 
 
 		 1244 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  56.84 
 
 		 1227 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  56.59 
 
 		 1244 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  56.59 
 
 		 1244 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  58.13 
 
 		 1229 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  56.84 
 
 		 1227 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  58.15 
 
 		 1224 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  56.84 
 
 		 1227 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  60.8 
 
 		 1304 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  56.76 
 
 		 1240 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  55.42 
 
 		 1228 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  60.19 
 
 		 1286 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  57.14 
 
 		 1227 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  57.59 
 
 		 1238 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  56.84 
 
 		 1227 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  57.68 
 
 		 1209 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  56.84 
 
 		 1227 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  56.59 
 
 		 1233 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  56.88 
 
 		 1246 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  56.84 
 
 		 1227 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  61.11 
 
 		 1293 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>