More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1433 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1433  methionine synthase I, homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 338 aa  695    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  63.25 
 
 		 1274 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  67.69 
 
 		 1261 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  67.69 
 
 		 334 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  64.02 
 
 		 1219 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  63.22 
 
 		 1245 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  61.72 
 
 		 1263 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  63.22 
 
 		 1278 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  61.61 
 
 		 1227 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  61.3 
 
 		 1249 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  59.94 
 
 		 1236 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  60.36 
 
 		 1235 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  61.92 
 
 		 1235 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  60.36 
 
 		 1235 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  60.95 
 
 		 1244 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  60.66 
 
 		 1235 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  60.65 
 
 		 1244 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.79 
 
 		 1239 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  59.88 
 
 		 1244 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  60.49 
 
 		 1239 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  60.48 
 
 		 1244 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  57.88 
 
 		 1225 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  61.68 
 
 		 1236 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  59.2 
 
 		 1228 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  60.36 
 
 		 1244 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  60.37 
 
 		 1238 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  59.76 
 
 		 1244 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  57.6 
 
 		 1245 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  61.16 
 
 		 1240 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  59.58 
 
 		 1244 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  59.88 
 
 		 1233 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  60.68 
 
 		 1241 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  59.88 
 
 		 1244 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  60.12 
 
 		 1246 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  60.06 
 
 		 1232 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  60 
 
 		 1234 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  56.65 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  59.63 
 
 		 1236 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.01 
 
 		 1226 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  60 
 
 		 1234 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  59.51 
 
 		 1230 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  59.02 
 
 		 1228 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  59.02 
 
 		 1232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  60.37 
 
 		 1250 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  58.72 
 
 		 1227 aa  404  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  59.75 
 
 		 1240 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  60.68 
 
 		 1229 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  59.49 
 
 		 1220 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  58.02 
 
 		 1272 aa  401  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  59.94 
 
 		 1224 aa  403  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  60.62 
 
 		 1271 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  61.28 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3617  methionine synthase (B12-dependent)  60.24 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732066  normal  0.0126884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  57.83 
 
 		 1247 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  56.25 
 
 		 1271 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  59.02 
 
 		 1227 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  60.73 
 
 		 1257 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3657  methionine synthase  61.92 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15726 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  57.59 
 
 		 1233 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  59.02 
 
 		 1227 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  59.02 
 
 		 1227 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  58.18 
 
 		 1237 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  60.8 
 
 		 1257 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  58.72 
 
 		 1227 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  57.91 
 
 		 1239 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  58.66 
 
 		 1227 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  60.82 
 
 		 1251 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  57.01 
 
 		 1245 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  56.92 
 
 		 1271 aa  394  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  58.56 
 
 		 1226 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2611  homocysteine S-methyltransferase  55.92 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  58.28 
 
 		 1250 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  57.88 
 
 		 1250 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  58.66 
 
 		 1227 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  58.66 
 
 		 1227 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45056  B12 dependent methionine synthase  58.95 
 
 		 1252 aa  391  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353368  normal  0.902557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1227 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  59.02 
 
 		 1252 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  58.18 
 
 		 1232 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1227 aa  391  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1227 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  59.44 
 
 		 1228 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  59.27 
 
 		 1264 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1227 aa  391  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  56.19 
 
 		 1226 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  57.75 
 
 		 1250 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1227 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0083  methionine synthase (B12-dependent)  60.18 
 
 		 366 aa  391  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  58.05 
 
 		 1227 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  60.62 
 
 		 1261 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  59.08 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  57.75 
 
 		 1250 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  57.75 
 
 		 1250 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  56.33 
 
 		 1226 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  58.44 
 
 		 1228 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  57.27 
 
 		 1227 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  60.62 
 
 		 1261 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  55.83 
 
 		 1220 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  56.23 
 
 		 1227 aa  388  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  57.85 
 
 		 1251 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>