276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6392 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  87.67 
 
 		 302 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  77 
 
 		 301 aa  474  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  55.03 
 
 		 299 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  53.02 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  52.68 
 
 		 311 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  51 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  52.36 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  53.54 
 
 		 307 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  51.69 
 
 		 300 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  52.03 
 
 		 300 aa  291  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  49.67 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  52.67 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  53.22 
 
 		 298 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  51.84 
 
 		 308 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  51.66 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  52.01 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  53.04 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  47.8 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  52.7 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  48.67 
 
 		 310 aa  275  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  50.85 
 
 		 302 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  43.79 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  40.47 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  37.89 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  36.09 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  34.52 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  36.88 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  34.08 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  30.74 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  32.38 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  31.95 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  30.94 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  30.16 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  28.89 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  27.39 
 
 		 807 aa  82.4  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  28.25 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  27.8 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  28.16 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  29.97 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  29.74 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  29.15 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  27.64 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.06 
 
 		 804 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  27.94 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.18 
 
 		 617 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2437  methionine synthase (B12-dependent)  28.27 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  27.18 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  24.67 
 
 		 768 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  24.67 
 
 		 768 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  23.84 
 
 		 780 aa  70.1  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  27.27 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  24.66 
 
 		 800 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  24.68 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.91 
 
 		 605 aa  66.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  27.91 
 
 		 818 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  27.11 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  25.87 
 
 		 1189 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  27.42 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  27.43 
 
 		 1263 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  26.32 
 
 		 801 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  27.08 
 
 		 1241 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.14 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  25.41 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  23.53 
 
 		 629 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  24.28 
 
 		 819 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  26.05 
 
 		 1169 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1406  homocysteine S-methyltransferase, putative  25 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  26.17 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  25 
 
 		 1232 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  25.17 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.07 
 
 		 615 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  27.93 
 
 		 1267 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.3 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  24.84 
 
 		 1223 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  27.01 
 
 		 1158 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  24.52 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  40.32 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  25.93 
 
 		 1250 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  24.55 
 
 		 1251 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  25.69 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  26.32 
 
 		 1192 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  25.66 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  25.87 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0709  methionine synthase I  26.3 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0843  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.42 
 
 		 611 aa  58.9  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2124  methionine synthase I  26.4 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.25 
 
 		 609 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  26.62 
 
 		 1225 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.94 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  25.25 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  24.35 
 
 		 791 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0799  methionine synthase I  26.4 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.57 
 
 		 605 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  28.62 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 		 804 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  26.23 
 
 		 1184 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  25.09 
 
 		 1238 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  26.55 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>