More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2160 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 310 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  51.68 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  52.07 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  49.49 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  48.67 
 
 		 305 aa  281  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  50.68 
 
 		 300 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  49.66 
 
 		 300 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  50 
 
 		 300 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  46.98 
 
 		 301 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  47.8 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  46.78 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  46.78 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  47.8 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  46.96 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  50 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  46.13 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  49.66 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  43.84 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  48.14 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  47.47 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  44.52 
 
 		 309 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  43.88 
 
 		 313 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  48.12 
 
 		 310 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  46.39 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  37.35 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  36.86 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  36.01 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  37.88 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  33.67 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  29.04 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  29.05 
 
 		 807 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  28.35 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  30.03 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  26.58 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  28.8 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  26.95 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  28.39 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  27.53 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  29.04 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  28.18 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  28.98 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  26.51 
 
 		 800 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  29.06 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  28.29 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  26.28 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  26.05 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  27.48 
 
 		 629 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  27.76 
 
 		 839 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  28.48 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  28.4 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  27.94 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  25.55 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.33 
 
 		 804 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.07 
 
 		 605 aa  75.9  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  26.47 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.08 
 
 		 1133 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.76 
 
 		 1133 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.27 
 
 		 609 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.44 
 
 		 1132 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.44 
 
 		 1132 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.44 
 
 		 1132 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  24.19 
 
 		 1212 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  27.41 
 
 		 768 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.62 
 
 		 1132 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  24.77 
 
 		 1184 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  27.41 
 
 		 768 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  27.48 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.3 
 
 		 1132 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  28.06 
 
 		 806 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  24.76 
 
 		 816 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  25.56 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  27.05 
 
 		 1252 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  25.55 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  26.56 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  21.63 
 
 		 1224 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  26.3 
 
 		 1132 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.92 
 
 		 1132 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  25.99 
 
 		 1232 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1406  homocysteine S-methyltransferase, putative  27.12 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4784  homocysteine S-methyltransferase  25.25 
 
 		 643 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.97 
 
 		 617 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  26.69 
 
 		 811 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  23.79 
 
 		 1188 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  25.08 
 
 		 1187 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  23.24 
 
 		 1261 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  26.6 
 
 		 1132 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  26.19 
 
 		 774 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  23.55 
 
 		 1215 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  23.58 
 
 		 1168 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1583  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.33 
 
 		 637 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3268  homocysteine S-methyltransferase  26.69 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  25.99 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  24.77 
 
 		 1238 aa  66.6  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  23.4 
 
 		 1188 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  24.27 
 
 		 1271 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  24.27 
 
 		 1271 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1750  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.01 
 
 		 598 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  26.59 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  24.92 
 
 		 1154 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3384  B12-dependent methionine synthase  26.37 
 
 		 1210 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>