More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0866 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  100 
 
 
316 aa  635    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  52.27 
 
 
311 aa  349  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  53.21 
 
 
325 aa  338  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  55.56 
 
 
315 aa  328  8e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  54.58 
 
 
312 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  55.3 
 
 
311 aa  322  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  54.6 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  54.07 
 
 
310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  56.11 
 
 
325 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  54.08 
 
 
288 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  51.61 
 
 
319 aa  279  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  52.04 
 
 
287 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  43.41 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  51.99 
 
 
303 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  48.99 
 
 
302 aa  255  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  50.17 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  40.51 
 
 
316 aa  239  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  50.17 
 
 
320 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  39.74 
 
 
310 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  42.35 
 
 
314 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  29.38 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  29.4 
 
 
418 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  28.39 
 
 
305 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  32.24 
 
 
801 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  32.38 
 
 
804 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  29.64 
 
 
841 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  32.92 
 
 
300 aa  99  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  29.68 
 
 
818 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  30.87 
 
 
311 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  32.03 
 
 
816 aa  96.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  23.81 
 
 
301 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  30.69 
 
 
297 aa  96.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  32.39 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  33.22 
 
 
610 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  30.55 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.26 
 
 
609 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  27.97 
 
 
629 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  31.55 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  28.66 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  31.37 
 
 
806 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  28.16 
 
 
304 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  31.73 
 
 
804 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.21 
 
 
605 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  24.26 
 
 
804 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.55 
 
 
610 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  27.56 
 
 
355 aa  92.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  30.29 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.43 
 
 
839 aa  92.4  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  33.01 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  27 
 
 
800 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  26.58 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  29.57 
 
 
819 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  27.76 
 
 
807 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  29.14 
 
 
1169 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  28.8 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.73 
 
 
605 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.31 
 
 
615 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2048  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.35 
 
 
614 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  29.6 
 
 
804 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  28.03 
 
 
803 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  32.39 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  31.56 
 
 
1226 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  22.73 
 
 
841 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  32.37 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.12 
 
 
604 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  26.23 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  32.08 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  29.78 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  29.1 
 
 
813 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  27.25 
 
 
1228 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  26.51 
 
 
1225 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  26.91 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  29.39 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  29.08 
 
 
1236 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  26.81 
 
 
1249 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  29.94 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  27.93 
 
 
1274 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.75 
 
 
617 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  29.62 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  27.27 
 
 
1224 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  27.25 
 
 
1227 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  32.01 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  28.25 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  27.96 
 
 
811 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  24.76 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  28.16 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  26.3 
 
 
1232 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  27.88 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  28.75 
 
 
804 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1406  homocysteine S-methyltransferase, putative  22.41 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  24.68 
 
 
774 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  26.58 
 
 
1224 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  27.85 
 
 
302 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  25.15 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  26.15 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.46 
 
 
605 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  28.29 
 
 
802 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02860  B12-dependent methionine synthase  26.92 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  22.07 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  26.95 
 
 
768 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>