265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02520 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  100 
 
 
381 aa  790    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  30.22 
 
 
355 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  26.27 
 
 
287 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  25.4 
 
 
313 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  24.93 
 
 
312 aa  99.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  25.07 
 
 
314 aa  99.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  24.6 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  27.37 
 
 
316 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  26.25 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  24 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  27.03 
 
 
288 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  25.86 
 
 
315 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  27.54 
 
 
320 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  23.06 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  25.07 
 
 
319 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  25.34 
 
 
325 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  25.34 
 
 
302 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  24.15 
 
 
316 aa  89.4  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  24.27 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  25.07 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  25.26 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  23.44 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  23.67 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  31.63 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  34.78 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  40.32 
 
 
302 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  40.32 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.18 
 
 
1132 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  29.76 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  37.1 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  33.78 
 
 
1171 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.18 
 
 
1133 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.18 
 
 
1133 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  34.72 
 
 
1168 aa  57  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  31.88 
 
 
301 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  23.16 
 
 
314 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.18 
 
 
1132 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.18 
 
 
1132 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.18 
 
 
1132 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.18 
 
 
1132 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.01 
 
 
617 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  34.33 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  35.9 
 
 
1132 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  37.35 
 
 
1245 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  35.9 
 
 
1132 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  34.38 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  28.87 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  39.44 
 
 
1136 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  35.9 
 
 
1223 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  35.06 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  38.55 
 
 
1267 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  37.33 
 
 
1178 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  37.35 
 
 
334 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  34.92 
 
 
346 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  34.62 
 
 
1132 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.33 
 
 
1132 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  37.31 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  39.06 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  36.14 
 
 
1220 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0115  homocysteine S-methyltransferase  33.73 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.165107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  37.31 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  39.06 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  34.43 
 
 
298 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  39.19 
 
 
1158 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  38.03 
 
 
1136 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  37.18 
 
 
1169 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0102  homocysteine S-methyltransferase  36.84 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  36.07 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0083  methionine synthase (B12-dependent)  36.84 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  35.16 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  38.46 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  33.04 
 
 
1227 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  34.94 
 
 
1230 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  34.94 
 
 
1231 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  32.47 
 
 
1196 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  35 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  36.92 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  34.94 
 
 
1230 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  33.73 
 
 
1263 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  44.59 
 
 
1167 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0172  methionine synthase (B12-dependent)  33.73 
 
 
348 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.727422  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  29.2 
 
 
1215 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  33.9 
 
 
310 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0166  methionine synthase (B12-dependent)  38.16 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0035  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  36.67 
 
 
612 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  27.2 
 
 
309 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1861  homocysteine S-methyltransferase  22.83 
 
 
434 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  35 
 
 
613 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  34.48 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  32.53 
 
 
1232 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0460  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  24.52 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  32.53 
 
 
1226 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  41.67 
 
 
615 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  31.15 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  43.24 
 
 
1171 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  35 
 
 
613 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  31.15 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  31.33 
 
 
1237 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  19.37 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>