More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0628 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  100 
 
 		 316 aa  648    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  57.28 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  42.26 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  41.46 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  43.09 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  40.51 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  43.91 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  43.04 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  42.39 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  44.55 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  42.58 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  41.75 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  40.26 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  41.75 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  39.47 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  37.62 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  37.5 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  36.54 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  35 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  32.78 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  29.08 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  25.54 
 
 		 418 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  28.66 
 
 		 819 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.65 
 
 		 605 aa  93.2  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  27.96 
 
 		 1223 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.86 
 
 		 804 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  25.84 
 
 		 1227 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  29.21 
 
 		 841 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  26.46 
 
 		 1228 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  26.44 
 
 		 1228 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  24.61 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  24.61 
 
 		 1254 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  26.95 
 
 		 800 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  26.75 
 
 		 1224 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  24.3 
 
 		 1208 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  26.24 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  26.91 
 
 		 1180 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2998  methionine synthase  27.52 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639431  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3347  methionine synthase (B12-dependent)  27.52 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  26.59 
 
 		 1189 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  26.3 
 
 		 1188 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  25.76 
 
 		 1238 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  26.71 
 
 		 841 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0460  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  27.49 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  24.61 
 
 		 1196 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  26.38 
 
 		 1264 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  26.15 
 
 		 1158 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  28.29 
 
 		 768 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  25.99 
 
 		 1227 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3657  methionine synthase  26.06 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15726 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  28.16 
 
 		 768 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  25.99 
 
 		 1188 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.44 
 
 		 1132 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.07 
 
 		 804 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.47 
 
 		 617 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  25.23 
 
 		 1182 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  26.52 
 
 		 1215 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  25.8 
 
 		 1236 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0083  methionine synthase (B12-dependent)  28.18 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.13 
 
 		 1132 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  23.96 
 
 		 1230 aa  79  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  28.85 
 
 		 813 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  26.58 
 
 		 1169 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  25.69 
 
 		 1227 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  27.11 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  27.3 
 
 		 816 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  25.3 
 
 		 1227 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28 
 
 		 1133 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  24.53 
 
 		 801 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  24.92 
 
 		 1182 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  24.09 
 
 		 1252 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  27.3 
 
 		 1197 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0102  homocysteine S-methyltransferase  26.83 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  23.71 
 
 		 1251 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28 
 
 		 1132 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.06 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.96 
 
 		 1132 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.65 
 
 		 807 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  26.06 
 
 		 1208 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.96 
 
 		 1132 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.44 
 
 		 1163 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  25.91 
 
 		 1227 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  26.51 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  28.39 
 
 		 1132 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0115  homocysteine S-methyltransferase  28.1 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.165107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28 
 
 		 1133 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  28.42 
 
 		 1262 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1433  methionine synthase I, homocysteine S-methyltransferase  28 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  27.11 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  29.18 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  28.3 
 
 		 1132 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  27.05 
 
 		 1261 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  26.3 
 
 		 1191 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  27.42 
 
 		 774 aa  75.9  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  25.61 
 
 		 1227 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  26.3 
 
 		 1191 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.96 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  26.15 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  26.23 
 
 		 1237 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  25.61 
 
 		 1227 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>