222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52412 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_52412  channel voltage activated chloride channel  100 
 
 		 693 aa  1426    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28245  voltage activated chloride channel CLC7 type  57.4 
 
 		 768 aa  744    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.385606  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50496  ClC family transporter: chloride ion channel  34.39 
 
 		 869 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.913408  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34455  ClC family transporter: chloride ion channel  29.28 
 
 		 802 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46097  predicted protein  33.21 
 
 		 980 aa  209  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 		 873 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  25.65 
 
 		 764 aa  198  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02308  ClC chloride ion channel (Eurofung)  29.05 
 
 		 828 aa  197  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.382711  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06107  CLC channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870M6]  28.45 
 
 		 909 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.20732  normal  0.131172 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03790  voltage-gated chloride channel, putative  29.64 
 
 		 897 aa  188  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14344  ClC family transporter: chloride ion channel  30 
 
 		 718 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06311  ClC chloride ion channel (Eurofung)  27.4 
 
 		 793 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  27.6 
 
 		 869 aa  160  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83582  chloride channel, possibly voltage gated  26.51 
 
 		 818 aa  154  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.64 
 
 		 473 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.64 
 
 		 473 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.64 
 
 		 473 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.64 
 
 		 473 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.64 
 
 		 473 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.17 
 
 		 439 aa  94  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  23.84 
 
 		 519 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.27 
 
 		 443 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  25 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  23.56 
 
 		 519 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  23.7 
 
 		 538 aa  86.3  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  24.8 
 
 		 897 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  23.26 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  24.71 
 
 		 863 aa  84  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  32.65 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  26.41 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.41 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.41 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  23.92 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.28 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  27.88 
 
 		 600 aa  77.4  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.36 
 
 		 589 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.52 
 
 		 598 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  24 
 
 		 859 aa  75.1  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.77 
 
 		 582 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  22.93 
 
 		 470 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  34.31 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  37.07 
 
 		 626 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.87 
 
 		 593 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.51 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  24.83 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  24.19 
 
 		 875 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30.45 
 
 		 863 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  29.73 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.28 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  32 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  23.42 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  23.69 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.98 
 
 		 754 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.54 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  30.96 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  30.96 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  27.27 
 
 		 879 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  27.27 
 
 		 879 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  30.96 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.18 
 
 		 587 aa  64.3  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  22.32 
 
 		 428 aa  63.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  30.41 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  25.57 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  22.56 
 
 		 462 aa  62  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  22.83 
 
 		 455 aa  62  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  23.85 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  22.42 
 
 		 585 aa  61.6  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  24.53 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  32.45 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  35.88 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37468  ClC family transporter: chloride ion channel  29.41 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00257506  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  24.53 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.81 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  24.03 
 
 		 528 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  26.53 
 
 		 593 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.15 
 
 		 636 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  23.83 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  37.04 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  20.99 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  27.22 
 
 		 628 aa  58.9  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  24.22 
 
 		 604 aa  58.9  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  23.72 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  24.9 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  20.55 
 
 		 559 aa  58.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  30.71 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  23.77 
 
 		 598 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  22.9 
 
 		 608 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  29.45 
 
 		 467 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  30.25 
 
 		 473 aa  57  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  26.32 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  27.14 
 
 		 463 aa  56.2  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  27.83 
 
 		 512 aa  56.6  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  26.19 
 
 		 470 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  26.32 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  30.25 
 
 		 473 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  28.08 
 
 		 510 aa  55.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  30.25 
 
 		 473 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  30.25 
 
 		 473 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  30.25 
 
 		 473 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>